Les problèmes de segmentation se rencontrent dans l'analyse de nombreux signaux biologiques, climatologiques, industriels, économiques. Ces analyses combinent souvent des problèmes algorithmiques dus à la taille de l'espace des segmentations possibles et des problèmes statistiques comme le choix du nombre de segments. En matière de sélection de modèle, les critères usuels (AIC, BIC) ne peuvent généralement pas s'appliquer naïvement à cause de la taille et de la forme de l'espace des segmentations. On présentera des critères de sélection du nombre de segments (de type BIC et ICL) fondés sur une exploration exhaustive de cet espace. Dans le domaine bio-médical, il est souvent nécessaire d'analyser simultanément des signaux mesurés sur plusieurs patients pour distinguer les ruptures d'éventuels artéfacts. On présentera ensuite un modèle mixte permettant la segmentation conjointe de profils chromosomiques, ainsi que l'algorithme E-M d'estimation. L'analyse conjointe de plusieurs profils permet également de rechercher des évènements (aberrations) récurrents parmi les patients atteints d'un même type de cancer. Pour un signal discret, ce problème s'apparente à l'étude des occurrences simultanées d'un motif dans plusieurs séquences pour lequel des bornes d'encadrement des probabilités critiques seront présentées.