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fulltext access A new data mining approach for the detection of bacterial promoters combining stochastic and combinatorial methods
Eng C., Asthana C., Aigle B., Hergalant S., Mari J.-F., Leblond P.
Journal of Computational Biology 16, 9 (2009) 1211-1225 [inria-00419969 - version 1]
SIGffRid: A tool to search for sigma factor binding sites in bacterial genomes using comparative approach and biologically driven statistics
Touzain F., Schbath S., Debled-Rennesson I., Aigle B., Kucherov G., Leblond P.
BMC Bioinformatics 9 (2008) [inria-00580657 - version 1]
restricted file access Fouille de données du génome à l'aide de modèles de Markov cachés
Hergalant S., Aigle B., Leblond P., Mari J.-F.
Dans Extraction et Gestion de Connaissances - EGC 2005 (2005) 141 -- 148 [inria-00001213 - version 1]
fulltext access SIGffRid : Programme de recherche des sites de fixation des facteurs de transcription par approche comparative
Touzain F., Schbath S., Debled-Rennesson I., Aigle B., Leblond P., Kucherov G.
Dans Journées Ouvertes Biologie Informatique Mathématiques - JOBIM'05 (2005) 417-425 [inria-00000191 - version 1]
restricted file access Classification non supervisée par HMM de sites de fixation de facteurs de transcription chez les bactéries
Hergalant S., Aigle B., Decaris B., Mari J.-F., Leblond P.
Dans 5èmes Journées Ouvertes : Biologie, Informatique et Mathématiques - JOBIM'04 (2004) 1 p [inria-00107788 - version 1]
Identification of Transcription Factor Binding Sites in Streptomyces coelicolor A3(2) by Phylogenetic Comparison
Touzain F., Lavigne P., Debled-Rennesson I., Aigle B., Leblond P., Kucherov G.
Dans European Conference for Computer Biology - ECCB'2003 (2003) [inria-00099608 - version 1]
Identification of transcription factor binding sites in the genome of Streptomyces coelicolor A3(2)
Lavigne P., Debled-Rennesson I., Aigle B., Leblond P., Kucherov G.
Dans 3ème Journées Post-Génomique de la DOUA 2003 - JPGD'03 (2003) [inria-00099609 - version 1]
HMM, an Efficient Way to Detect Transcriptional Promoters in Bacterial Genomes?
Hergalant S., Aigle B., Decaris B., Mari J.-F., Leblond P.
Dans European Conference on Computational Biology - ECCB'2003 (2003) 417--419 [inria-00099570 - version 1]
Intragenomic reiterations detection using hidden Markov models
Hergalant S., Aigle B., Decaris B., Leblond P., Mari J.-F.
Dans 10th International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology - ISMB 2002 (2002) 1 p [inria-00100914 - version 1]
Fouille de données à l'aide de HMM : Application à la détection de réitérations intragénomiques
Hergalant S., Aigle B., Decaris B., Leblond P., Mari J.-F.
Dans Journées Ouvertes Biologie Informatique Mathématiques - JOBIM'02 (2002) 269-273 [inria-00100752 - version 1]