hal-00358487, version 1
The genome of the sea urchin Strongylocentrotus purpuratus.
1 2 3, 4 5, 6, 7 8, 9 10, 11, 12 13, 14 15 16, 17 18 19 20, 21, 22 23 24 25, 26 27 28 27 27 29 27 27 30, 31, 32 13 33 34 35 36 37 38 15 39, 40 41 42 43 44 45, 46, 47 48, 49, 50 51 52 53, 54, 55 56 57, 58, 59 60, 61 62, 63 64 65 66, 67, 68 69 70 71 72, 73, 74 75, 76, 77 78, 79 80, 81 82 83, 84, 85 86, 87 84, 88 89 90, 91, 92 93, 94 23, 95 96, 97
Science 314, 5801 (2006) 941-52
Résumé : We report the sequence and analysis of the 814-megabase genome of the sea urchin Strongylocentrotus purpuratus, a model for developmental and systems biology. The sequencing strategy combined whole-genome shotgun and bacterial artificial chromosome (BAC) sequences. This use of BAC clones, aided by a pooling strategy, overcame difficulties associated with high heterozygosity of the genome. The genome encodes about 23,300 genes, including many previously thought to be vertebrate innovations or known only outside the deuterostomes. This echinoderm genome provides an evolutionary outgroup for the chordates and yields insights into the evolution of deuterostomes.
- 1 :
- Stony Brook University
- 2 :
- Queen Mary, University of London
- 3 :
- CSIRO Energy Technology
- 4 :
- Commonwealth Scientific and Industrial Research Organisation
- 5 :
- Boston University
- 6 :
- Boston University
- 7 :
- Max-Planck-Institut
- 8 :
- Australian Antarctic Division
- 9 :
- Department of Sustainability, Environment, Water, Population & Communities
- 10 :
- University of Oxford
- 11 :
- London School of Economics and Political Science
- 12 :
- Thomas Jefferson National Accelerator Facility
- 13 :
- Inconnu
- 14 :
- CNRS : UMR7563 – Institut National Polytechnique de Lorraine (INPL) – Université Henri Poincaré - Nancy I
- 15 :
- CNRS : UPR9034
- 16 :
- University of Illinois at Urbana-Champaign
- 17 :
- Portland State University
- 18 :
- SAINT-GOBAIN
- 19 :
- Biotechnology and Biological Sciences Research Council
- 20 :
- Chinese Academy of Science (CAS)
- 21 :
- IPSEN
- 22 :
- University of California, Berkeley
- 23 :
- University of Leeds
- 24 :
- Chung-Ang University
- 25 :
- Antarctic Climate and Ecosystems
- 26 :
- Technische Universität München
- 27 :
- CNRS : UMR7150 – Université Pierre et Marie Curie [UPMC] - Paris VI
- 28 :
- Imperial College London
- 29 :
- National physical laboratory
- 30 :
- The Earth Institute of Columbia University
- 31 :
- The Macaulay Institute
- 32 :
- University of Cambridge
- 33 :
- Queen's University
- 34 :
- University of Cape Town
- 35 :
- Istituto per la Microelettronica e Microsistemi
- 36 :
- CNRS : UMR6613 – Université du Maine
- 37 :
- Carnegie Mellon University
- 38 :
- Chinese Academy of Science (CAS)
- 39 :
- INRIA – CNRS : UMR8623 – Université Paris XI - Paris Sud
- 40 :
- Clean Air Task Force
- 41 :
- Indian Space Research Organisation
- 42 :
- CNRS : UMR5820 – Université Pierre-Mendès-France - Grenoble II
- 43 :
- College of Medicine and Health Sciences – Sultan Qaboos University
- 44 :
- European Molecular Biology Laboratory
- 45 :
- University of Michigan
- 46 :
- University of Michigan
- 47 :
- University of Leicester
- 48 :
- CNRS : FRE3190 – Université d'Evry-Val d'Essonne
- 49 :
- Technical University of Karlsruhe
- 50 :
- University of New Brunswick
- 51 :
- CNRS : UMR6057 – Université de Provence - Aix-Marseille I
- 52 :
- CNRS : UMR6226 – Université de Rennes 1 – Institut National des Sciences Appliquées (INSA) - Rennes – Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Rennes
- 53 :
- CNRS : UMR6282 – Université de Bourgogne
- 54 :
- Bioprojet
- 55 :
- CNRS : UMR7016 – Université de Haute Alsace - Mulhouse – Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Mulhouse
- 56 :
- University of Science and Technology Beijing
- 57 :
- University of Colorado at Boulder
- 58 :
- University of Sheffield
- 59 :
- University of Sheffield
- 60 :
- CNRS : UMR8107 – Université Lille I - Sciences et technologies – Ecole Centrale de Lille – Arts et Métiers ParisTech
- 61 :
- University of California, Los Angeles
- 62 :
- CNRS : UMR8080 – Université Paris XI - Paris Sud
- 63 :
- CNRS : UMR7009 – Université Pierre et Marie Curie [UPMC] - Paris VI
- 64 :
- CNRS : UMR8551 – Université Pierre et Marie Curie [UPMC] - Paris VI – Université Paris VII - Paris Diderot – Ecole normale supérieure de Paris - ENS Paris
- 65 :
- Mac Gill University
- 66 :
- Universidad nacional del Comahue
- 67 :
- CEA – Université Joseph Fourier - Grenoble I
- 68 :
- CNRS : UMR5805 – INSU – Université Sciences et Technologies - Bordeaux I – Ecole Pratique des Hautes Etudes – Observatoire Aquitain des Sciences de l'Univers
- 69 :
- CNRS : UMR7592 – Université Paris VII - Paris Diderot
- 70 :
- INFN
- 71 :
- Universitat Autónoma Barcelona
- 72 :
- Max-Planck-Institut
- 73 :
- Chinese Academy of Science (CAS)
- 74 :
- National Chiao Tung University
- 75 :
- University of Arizona
- 76 :
- University of Cape Town
- 77 :
- University of York
- 78 :
- Peking University / Beijing
- 79 :
- University of Iowa
- 80 :
- NASA
- 81 :
- Imperial College London
- 82 :
- Hankuk University of Foreign Studies
- 83 :
- University of Warwick
- 84 :
- STFC Rutherford Appleton Laboratory
- 85 :
- CNRS : UMR5086 – Université Claude Bernard - Lyon I
- 86 :
- Rutherford Appleton Laboratory
- 87 :
- Met Office
- 88 :
- University College of London (UCL)
- 89 :
- School of Medicine – University of California, Los Angeles
- 90 :
- Seoul National University
- 91 :
- Seoul Women's University
- 92 :
- Nanyang Technological University
- 93 :
- McGill University – Université de Sherbrooke – Université de Montréal – Ecole Polytechnique Montréal – Fonds Québécois de Recherche sur la Nature et les Technologies (FQRNT)
- 94 :
- Université de Montréal
- 95 :
- University of Leeds
- 96 :
- NERC - Natural Environment Research Council
- 97 :
- Norwegian Institute for Water Research
- Domaine : Sciences du Vivant/Biochimie, Biologie Moléculaire
- hal-00358487, version 1
- http://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00358487
- oai:hal.archives-ouvertes.fr:hal-00358487
- Contributeur :
- Soumis le : Mardi 3 Février 2009, 15:37:07
- Dernière modification le : Vendredi 27 Novembre 2009, 16:08:53
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