inria-00526379, version 1

Simulation and analysis of an individual-based model for graph-structured plant dynamics

Fabien Campillo () ^1, 2, 3, Nicolas Champagnat () ⁴

Ecological Modelling 234 (2012) 93-105

• 1 :  MERE (INRIA Sophia Antipolis - INRA/SupAgro UMR 0729 MISTEA - Montpellier)
• http://www-sop.inria.fr/mere/
  INRIA – Institut national de la recherche agronomique (INRA) : UMR0729 MERE Project - INRA/INRIA UMR MISTEA - bât. 21 - Etage 3 2, place Pierre Viala 34000 Montpellier France France
• 2 :  Mathématiques, Informatique et STatistique pour l'Environnement et l'Agronomie (MISTEA)
• 
  Institut national de la recherche agronomique (INRA) INRA 2, place Viala F-34060 Montpellier Cedex 1 France
• 3 :  MODEMIC (INRIA Sophia Antipolis)
• http://www-sop.inria.fr/modemic/
  INRIA – Institut national de la recherche agronomique (INRA) INRA/INRIA UMR MISTEA - bât. 29 2, place Pierre Viala 34060 Montpellier cedex 01 France
• 4 :  TOSCA (INRIA Sophia Antipolis / INRIA Lorraine / IECN)
• 
  INRIA – CNRS : UMR7502 – Université Henri Poincaré - Nancy I – Université Nancy II – Institut National Polytechnique de Lorraine (INPL) 2004 route des Lucioles BP 93 F-06902 Sophia Antipolis (France) France

Références bibliographiques

• Type de publication : Articles dans des revues avec comité de lecture
• Domaine :

  Sciences du Vivant/Ecologie, Environnement/Ecosystèmes

  Mathématiques/Probabilités

• Titre : Simulation and analysis of an individual-based model for graph-structured plant dynamics
• Résumé : We propose a stochastic individual-based model for clonal plant dynamics in continuous time and space, focusing on the effects of the network structure of the plants on the reproductive strategy of ramets. This model is coupled with an explicit advection-diffusion dynamics for resources. After giving a partially exact simulation scheme of the model, the capacity of the model to reproduce specific features of clonal plants, such as their efficiency to forage resources over the field, is numerically studied. Next, we propose a large population approximation of the model for phalanx-type populations, taking the form of an advection-diffusion PDE for population densities, where the influence of the local graph structure of the plant takes the form of a nonlinear dependence in the gradient of resources. Finally, extensions of the model and other possible large population scalings are discussed.
• Langue du document : Anglais
• Titre de la revue :

  Ecological Modelling
  Publisher	Elsevier
  ISSN	0304-3800

• Date de publication : 2012
• Audience : internationale
• Editeur commercial : Elsevier
• Volume : 234
• Pagination : 93-105
• DOI : 10.1016/j.ecolmodel.2012.03.017
• Mots-clés : Markov process – individual-based model (IBM) – clonal plant
• Projet ANR :

  Référence du projet

  MODECOL

Liste des fichiers attachés à ce document :

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• http://hal.inria.fr/inria-00526379
• oai:hal.inria.fr:inria-00526379
• Contributeur : Nicolas Champagnat <>
• Soumis le : Jeudi 14 Octobre 2010, 14:20:27
• Dernière modification le : Jeudi 7 Février 2013, 11:22:26