hal-00723387, version 1

Can Voronoi diagram model cell geometries in early sea-urchin embryogenesis ?

Miguel A. Luengo-Oroz ¹, Louise Duloquin ^2, 3, C. Castro ¹, Thierry Savy ⁴, Emmanuel Faure ⁴, B. Lombardot, Paul Bourgine ^4, 5, Nadine Peyrieras ^2, 3, 6, A. Santos ¹

Biomedical Imaging: From Nano to Macro IEEE (Ed.) (2008) 504-507

• 1 :  Biomedical Image Technologies Lab, ETSI Telecomunicación
• 
  Universidad Politécnica de Madrid Madrid Espagne
• 2 :  Neurobiologie et Développement (N&eD)
• http://www.inaf.cnrs-gif.fr/ned/accueil.html
  CNRS : UPR3294 – Université Paris XI - Paris Sud Institut de Neurobiologie Alfred Fessard, Bât 33, 1 avenue de la Terrasse 91198 Gif-sur-Yvette Cedex France
• 3 :  Institut de Neurobiologie Alfred Fessard (INAF)
• http://www.inaf.cnrs-gif.fr/
  CNRS : FRC2118 Bât. 32/33 1 Avenue de la terrasse 91198 GIF SUR YVETTE CEDEX France
• 4 :  Centre de recherche en épistémologie appliquée (CREA)
• http://www.crea.polytechnique.fr/LeCREA/
  CNRS : UMR7656 – Polytechnique - X ROUTE DE SACLAY 91128 PALAISEAU CEDEX France
• 5 :  Réseau National des Systèmes Complexes (RNSC)
• http://rnsc.fr
  CNRS : UMR0 – INSERM : U0 – Institut national de la recherche agronomique (INRA) : UMR0 – Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER) – Centre de coopération internationale en recherche agronomique pour le développement [CIRAD] : UMR0 – INRIA – Institut de recherche pour le développement [IRD] – CGE – CPU 57-59 rue Lhomond, Paris 75005 France
• 6 :  Institut des Systèmes Complexes - Paris Ile-de-France (ISC-PIF)
• http://iscpif.fr
  CNRS : UMR7656 – Institut Curie – Université Paris XI - Paris Sud – Université Paris I - Panthéon-Sorbonne – Université Pierre et Marie Curie [UPMC] - Paris VI – École normale supérieure de Cachan - ENS Cachan – Ecole normale supérieure de Paris - ENS Paris – Polytechnique - X 57-59 rue Lhomond 75005 Paris France

Références bibliographiques

• Type de publication : Chapitres d'ouvrages scientifiques
• Domaine : Sciences du Vivant/Neurosciences
• Titre : Can Voronoi diagram model cell geometries in early sea-urchin embryogenesis ?
• Résumé : We test the hypothesis that cell membranes in early sea- urchin embryos can be modeled as a Voronoi diagram from nuclei centers. In order to obtain a model of the cell geometry against which to test our Voronoi model hypothesis, we developed a viscous watershed framework that allows segmenting 3D images of living sea-urchin embryos obtained by biphoton laser scanning microscopy. Measurements of the differences between segmented cells and the Voronoi model, show an interesting high correlation that can serve for developing more accurate methods of segmentation and modelling cell geometries.
• Langue du texte
  intégral : Anglais
• DOI : 10.1109/ISBI.2008.4541043
• ISBN : 978-1-4244-2002-5
• Audience : internationale
• Titre de l'ouvrage : Biomedical Imaging: From Nano to Macro
• Éditeur commercial : IEEE
• Date de publication : 2008
• Page : 504-507
• Série/Collection : IEEE International Symposium on Biomedical Imaging Vomues 1-4
• Commentaire : 5th IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Paris, FRANCE, MAY 14-17, 2008

• hal-00723387, version 1
• http://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00723387
• oai:hal.archives-ouvertes.fr:hal-00723387
• Contributeur : Alain Perignon <>
• Soumis le : Jeudi 9 Août 2012, 14:28:42
• Dernière modification le : Jeudi 9 Août 2012, 14:28:42