GPSy: a cross-species gene prioritization system for conserved biological processes--application in male gamete development.

Ramona Britto; Olivier Sallou; Olivier Collin; Grégoire Michaux; Michael Primig; Frédéric Chalmel

inserm-00696905, version 1

GPSy: a cross-species gene prioritization system for conserved biological processes--application in male gamete development.

Ramona Britto ¹, Olivier Sallou ^2, 3, Olivier Collin ^2, 3, Grégoire Michaux ⁴, Michael Primig ¹, Frédéric Chalmel ( Auteur à contacter de préférence ) ¹

Nucleic Acids Research (2012) epub ahead of print

Résumé : We present gene prioritization system (GPSy), a cross-species gene prioritization system that facilitates the arduous but critical task of prioritizing genes for follow-up functional analyses. GPSy's modular design with regard to species, data sets and scoring strategies enables users to formulate queries in a highly flexible manner. Currently, the system encompasses 20 topics related to conserved biological processes including male gamete development discussed in this article. The web server-based tool is freely available at http://gpsy.genouest.org.

1 : Institut de recherche, santé, environnement et travail (Irset)
INSERM : U1085 – Université de Rennes 1 – École Nationale de la Santé Publique – Université des Antilles et de la Guyane – Biosit
2 : Plateforme bioinformatique GenOuest
Biogenouest – Université de Rennes 1
3 : SED (INRIA - IRISA)
INRIA – CNRS : UMR6074 – Université de Rennes 1
4 : Institut de Génétique et Développement de Rennes (IGDR)
Université de Rennes 1 – CNRS : UMR6290 – Biosit

inserm-00696905, version 1
http://www.hal.inserm.fr/inserm-00696905
oai:www.hal.inserm.fr:inserm-00696905
Contributeur : Hervé De Villemeur <>
Soumis le : Lundi 14 Mai 2012, 10:11:29
Dernière modification le : Mardi 15 Mai 2012, 08:52:10

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PubMed : 22570409

PubMed Central : 3394256

DOI : 10.1093/nar/gks380

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