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inria-00099609, version 1

Identification of transcription factor binding sites in the genome of Streptomyces coelicolor A3(2)

Patricia Lavigne () a1, Isabelle Debled-Rennesson a1, Bertrand Aigle b, Pierre Leblond b, Gregory Kucherov a1

3ème Journées Post-Génomique de la DOUA 2003 - JPGD'03 (2003)

Résumé : Search of over-represented motifs in the genome of Streptomyces coelicolor A3(2) using R'MES (statistical approach) and location so as to define putative transcription factor binding sites.

  • a –  INRIA
  • b –  UMR INRA-UHP 1128
  • 1 :  ADAGE (INRIA Lorraine - LORIA)
  • INRIA – CNRS : UMR7503 – Université Henri Poincaré - Nancy I – Université Nancy II – Institut National Polytechnique de Lorraine (INPL)
  • Domaine : Informatique/Autre
  • Mots-clés : binding site – transcription factor – statistical approach || site de liaison – facteur de transcription – approche statistique
  • Référence interne : A03-R-285 || lavigne03a
  • Commentaire : Colloque avec actes sans comité de lecture. nationale.
 
  • inria-00099609, version 1
  • oai:hal.inria.fr:inria-00099609
  • Contributeur : 
  • Soumis le : Mardi 26 Septembre 2006, 09:39:21
  • Dernière modification le : Jeudi 28 Septembre 2006, 15:22:46