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A new data mining approach for the detection of bacterial promoters combining stochastic and combinatorial methods Eng C., Asthana C., Aigle B., Hergalant S., Mari J.-F., Leblond P. Journal of Computational Biology 16, 9 (2009) 1211-1225 [inria-00419969 - version 1]

Data Mining Using Hidden Markov Models (HMM2) to Detect Heterogeneities into Bacteria Genomes Eng C., Thibessard A., Hergalant S., Mari J.-F., Leblond P. Dans Journées Ouvertes Biologie, Informatique et Mathématiques - JOBIM 2005 (2005) [inria-00000142 - version 1]

Fouille de données du génome à l'aide de modèles de Markov cachés Hergalant S., Aigle B., Leblond P., Mari J.-F. Dans Extraction et Gestion de Connaissances - EGC 2005 (2005) 141 -- 148 [inria-00001213 - version 1]

FouDanGA : Fouille de données pour l'annotation de génomes d'actinomycètes Mari J.-F., Touzain F., Hergalant S., Debled-Rennesson I. (2005) [inria-00000453 - version 1]

Classification non supervisée par HMM de sites de fixation de facteurs de transcription chez les bactéries Hergalant S., Aigle B., Decaris B., Mari J.-F., Leblond P. Dans 5èmes Journées Ouvertes : Biologie, Informatique et Mathématiques - JOBIM'04 (2004) 1 p [inria-00107788 - version 1]

HMM, an Efficient Way to Detect Transcriptional Promoters in Bacterial Genomes? Hergalant S., Aigle B., Decaris B., Mari J.-F., Leblond P. Dans European Conference on Computational Biology - ECCB'2003 (2003) 417--419 [inria-00099570 - version 1]

Intragenomic reiterations detection using hidden Markov models Hergalant S., Aigle B., Decaris B., Leblond P., Mari J.-F. Dans 10th International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology - ISMB 2002 (2002) 1 p [inria-00100914 - version 1]

Fouille de données à l'aide de HMM : Application à la détection de réitérations intragénomiques Hergalant S., Aigle B., Decaris B., Leblond P., Mari J.-F. Dans Journées Ouvertes Biologie Informatique Mathématiques - JOBIM'02 (2002) 269-273 [inria-00100752 - version 1]

Segmentation du génome de Streptomyces coelicolor par chaînes de Markov pour la recherche de réitérations Hergalant S. N° A01-R-392 || hergalant01a (2001) [inria-00100649 - version 1]