La collection des Cahiers de la MSHE Ledoux, éditée par les Presses universitaires de Franche-Comté, a pour objectif de publier des ouvrages individuels ou collectifs qui restituent à la communauté scientifique et à un public large les résultats des recherches menées au sein de la Maison des sciences de l'homme et de l'environnement Claude Nicolas Ledoux.
La collection se décline actuellement en sept séries. Cinq d'entre elles correspondent aux cinq pôles de recherche de la MSHE Ledoux :
- Dynamiques territoriales
- Homme et environnement
- Normes, pratiques et savoirs
- Archives, bases, corpus
- Comportements, risques, santé
Les deux autres séries sont thématiques :
- Archives de l'imaginaire social
- Normes et pratiques foncières et agricoles dans le monde