Interactions of intergenic microRNAs with mRNAs of genes involved in carcinogenesis

Assel Issabekova 1 Olga Berillo 1 Mireille Regnier 2, 3 Anatoly Ivashchenko 1, *
* Auteur correspondant
2 AMIB - Algorithms and Models for Integrative Biology
LIX - Laboratoire d'informatique de l'École polytechnique [Palaiseau], LRI - Laboratoire de Recherche en Informatique, UP11 - Université Paris-Sud - Paris 11, Inria Saclay - Ile de France
Résumé : miRNAs regulent l'expression des genes par fixation avec le mRNAs de nombreux gènes. L'étude de leur effet sur les gènes impliqués dans l'oncogénèse est importante pour le diagnostic du cancer et sa thérapeutique. Le programme RNAHybrid 2.1 a été utilisé pour prédire des sites de fixation forts de miRNA (p < 0.0005) dans des mRNAs cibles. Le program Finder 2.2 a été écrit pour vérifier l'origine 784 miRNAs intergeniques (ig-miRNA) . Plusieurs miRNAs ne reegulent effectivement qu'un seul gène et cette information pourrait être utile en médecine moléculaire pour modérer la traduction du mRNA cible.
Type de document :
Article dans une revue
Bioinformation, Biomedical Informatics Publishing Group, 2012, 8 (11), pp.513-518. 〈10.6026/97320630008513〉
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https://hal.inria.fr/hal-00736694
Contributeur : Mireille Regnier <>
Soumis le : vendredi 28 septembre 2012 - 17:35:25
Dernière modification le : mercredi 14 novembre 2018 - 16:08:06

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Assel Issabekova, Olga Berillo, Mireille Regnier, Anatoly Ivashchenko. Interactions of intergenic microRNAs with mRNAs of genes involved in carcinogenesis. Bioinformation, Biomedical Informatics Publishing Group, 2012, 8 (11), pp.513-518. 〈10.6026/97320630008513〉. 〈hal-00736694〉

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