An Adaptive Combination of Matchers: Application to the Mapping of Biological Ontologies for Genome Annotation

Rance Bastien 1 Jean-François Gibrat 2 Christine Froidevaux 1, 3
3 AMIB - Algorithms and Models for Integrative Biology
CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR8623, X - École polytechnique, Inria Saclay - Ile de France, UP11 - Université Paris-Sud - Paris 11, LRI - Laboratoire de Recherche en Informatique, LIX - Laboratoire d'informatique de l'École polytechnique [Palaiseau]
Résumé : Les ontologies sont largement utilisées pour l'annotation de génomes. Ce papier introduit O'Browser, une méthode semi-automatique pour mettre en correspondance deux hiérarchies fonctionnelles en utilisant deux ensembles de protéines soigneusement annotées. On utilise la notion originale de pondération adaptative. La capacité d'O'Browser d'associer des concepts de deux hiérarchies fonctionnelles, Subtilist et FunCat, est démontrée.
Type de document :
Communication dans un congrès
Norman W. Paton and Paolo Missier and Cornelia Hedeler. DILS 2009-6th International Workshop on Data Integration in the Life Sciences, Jul 2009, Manchester, United Kingdom. Springer, 5647, pp.113-126, 2009, Lecture Notes in Computer Science. 〈10.1007/978-3-642-02879-3_10〉
Liste complète des métadonnées

https://hal.inria.fr/hal-00781428
Contributeur : Mireille Regnier <>
Soumis le : samedi 26 janvier 2013 - 17:09:41
Dernière modification le : jeudi 10 mai 2018 - 02:06:06

Identifiants

Collections

Citation

Rance Bastien, Jean-François Gibrat, Christine Froidevaux. An Adaptive Combination of Matchers: Application to the Mapping of Biological Ontologies for Genome Annotation. Norman W. Paton and Paolo Missier and Cornelia Hedeler. DILS 2009-6th International Workshop on Data Integration in the Life Sciences, Jul 2009, Manchester, United Kingdom. Springer, 5647, pp.113-126, 2009, Lecture Notes in Computer Science. 〈10.1007/978-3-642-02879-3_10〉. 〈hal-00781428〉

Partager

Métriques

Consultations de la notice

309