Quantitative Analysis of Cell Migration Using Optical Flow

Katica Boric 1 Patricio Orio 2 Thierry Viéville 3 Kathleen Whitlock 2
3 Mnemosyne - Mnemonic Synergy
LaBRI - Laboratoire Bordelais de Recherche en Informatique, Inria Bordeaux - Sud-Ouest, IMN - Institut des Maladies Neurodégénératives [Bordeaux]
Résumé : Les cellules de la crête neurale peuvent présenter des comportements migratoires cliniquement dramatiques lors de leur migration distante. En utilisant un marqueur exprimant la protéine fluorescente verte (SOX10: EGFP) dans les cellules de la crête neurale, nous avons développé un test pour analyser et quantifier la migration cellulaire en tant que population, et caractériser en détail les défauts subtils dans la migration cellulaire causée par l'exposition à l'éthanol, au début du développement neural. Le défi était de quantifier les changements dans la migration in vivo de toutes les cellues de type Sox10:EGFP observable dans le champ visuel des films réalisés à très basse fréquence. Pour réaliser cette analyse, nous avons utilisé un algorithme de flux optique pour la détection de mouvement et combiné l'analyse avec un ajustement par une transformation affine. Grâce à cette analyse, nous avons détectés et quantifiés des différences notoires dans les migrations cellulaires de populations soumises à l'éthanol, au regard d'embryons non traités. Plus précisément, la migration est affectée par unec augmentation de l'asymétrie gauche-droite des cellules migrantes et une modification de la direction des mouvements cellulaires. En appliquant cette analyse computationnelle, nous avons été en mesure de quantifier les mouvements de populations de cellules, permettant de détecter des changements subtils dans les comportements cellulaires. Les cellules de la crête neurale crânienne contribuant à la formation de la masse cranienne antérieure, ces asymétries sous-tendent fréquemment des asymétries faciales observés dans les populations humaines concernées.
Type de document :
Article dans une revue
Liste complète des métadonnées

https://hal.inria.fr/hal-00850523
Contributeur : Thierry Viéville <>
Soumis le : mercredi 7 août 2013 - 10:30:49
Dernière modification le : jeudi 11 janvier 2018 - 06:24:26

Identifiants

  • HAL Id : hal-00850523, version 1

Collections

Citation

Katica Boric, Patricio Orio, Thierry Viéville, Kathleen Whitlock. Quantitative Analysis of Cell Migration Using Optical Flow. PLoS ONE, Public Library of Science, 2013, 〈http://www.plosone.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pone.0069574〉. 〈hal-00850523〉

Partager

Métriques

Consultations de la notice

145