Suivi de la leucémie résiduelle par séquençage haut-débit

Résumé : Le séquençage à haut débit offre de nouvelles perspectives pour le suivi de la leucémie. Nous proposons un algorithme pouvant traiter des millions de séquences, capable de différencier les réarrangements V(D)J qui s'opèrent au sein des lymphocytes, et de les quantifier. Il est désormais possible de suivre une population clonale de lymphocytes ou de lymphoblastes au cours du temps et, en pathologie, de mesurer sa réaction au traitement. La méthode proposée est implémentée dans un logiciel open-source appelé Vidjil, et testée sur plusieurs échantillons d'un patient atteint de leucémie aiguë lymphoblastique.
Type de document :
Communication dans un congrès
JOBIM, Jul 2013, Toulouse, France. 2013
Liste complète des métadonnées

https://hal.inria.fr/hal-00857581
Contributeur : Mikaël Salson <>
Soumis le : mardi 3 septembre 2013 - 16:52:33
Dernière modification le : vendredi 8 janvier 2016 - 01:06:54

Identifiants

  • HAL Id : hal-00857581, version 1

Citation

Mathieu Giraud, Mikaël Salson, Marc Duez, Jean-Stéphane Varré, Céline Villenet, et al.. Suivi de la leucémie résiduelle par séquençage haut-débit. JOBIM, Jul 2013, Toulouse, France. 2013. <hal-00857581>

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