Analysis of pattern overlaps and exact computation of P-values of pattern occurrences numbers: case of Hidden Markov Models

Résumé : Cet article présente un nouvel algorithme, SufPref, qui calcule la pvaleur pour un ensemble de mots qui prend en compte les modèles de Markov cachés (HMM). Il est implémenté en C++ et peut être utilisé en ligne ou téléchargé.
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Algorithms for Molecular Biology, BioMed Central, 2014, 9 (1), 〈10.1186/s13015-014-0025-1〉
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Contributeur : Mireille Regnier <>
Soumis le : jeudi 5 septembre 2013 - 17:46:05
Dernière modification le : mercredi 14 novembre 2018 - 16:08:06
Document(s) archivé(s) le : jeudi 6 avril 2017 - 16:00:35

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Mireille Régnier, Evgenia Furletova, Victor Yakovlev, Mikhail Roytberg. Analysis of pattern overlaps and exact computation of P-values of pattern occurrences numbers: case of Hidden Markov Models. Algorithms for Molecular Biology, BioMed Central, 2014, 9 (1), 〈10.1186/s13015-014-0025-1〉. 〈hal-00858701〉

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