Elementary flux modes analysis of functional domain networks allows a better metabolic pathway interpretation

Sabine Pérès 1, 2 Liza Felicori 3 Franck Molina 4
2 AMIB - Algorithms and Models for Integrative Biology
CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR8623, Polytechnique - X, Inria Saclay - Ile de France, UP11 - Université Paris-Sud - Paris 11, LRI - Laboratoire de Recherche en Informatique, LIX - Laboratoire d'informatique de l'École polytechnique [Palaiseau]
Résumé : Nous introduisons une nouvelle méthode de représentation des réseaux métaboliques comme des réseaux de domaines fonctionnels. Nous appliquons notre algorithme au calcul de modes de flux élémentaires et les analysons. Cette méthodologie est utilisée sur le cycle TCA de Bacillus Subtilis et comparée aux analyses classiques.
Type de document :
Article dans une revue
PLoS ONE, Public Library of Science, 2013
Liste complète des métadonnées

https://hal.inria.fr/hal-00861577
Contributeur : Mireille Regnier <>
Soumis le : vendredi 13 septembre 2013 - 10:04:02
Dernière modification le : jeudi 11 janvier 2018 - 06:23:16

Identifiants

  • HAL Id : hal-00861577, version 1

Citation

Sabine Pérès, Liza Felicori, Franck Molina. Elementary flux modes analysis of functional domain networks allows a better metabolic pathway interpretation. PLoS ONE, Public Library of Science, 2013. 〈hal-00861577〉

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