Comparação de métodos para determinação de SNPs com medidas de confiabilidade

Résumé : Neste trabalho realizamos estudos sobre métodos para a identificação de polimorfismos de base única, comumente conhecidos pela sigla SNP (em inglês, Single Nucleotide Polymorphism). Identificar este tipo de polimorfismo é um processo importante pois, devido ao fato de eles poderem influenciar a estabilidade ou, até mesmo, a estrutura das proteínas codificadas pelos genes, os SNPs podem estar relacionados a diversas doenças. Um bom método de identificação deve ser capaz de apontar as posições polimórficas e fornecer uma medida de confiabilidade para a detecção realizada. Neste sentido, estudamos dois métodos: polybayes e MSASNP.O primeiro método trata-se de um programa que realiza análise bayesiana para análise das seqüências e identificação de SNPs. O segundo método adota uma estratégia simples, utilizando conceitos básicos de probabilidade. Os testes mostraram que o polybayes é o mais indicado por ser capaz de indentificar os SNPs e fornecer valores mais confiáveis sobre a probabilidade de detecção correta de um SNP.
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Rapport
[Technical Report] 06-15, Instituto de Computação - UNICAMP. 2006
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Contributeur : Christian Baudet <>
Soumis le : mardi 9 décembre 2014 - 21:54:20
Dernière modification le : vendredi 16 septembre 2016 - 15:14:24
Document(s) archivé(s) le : mardi 10 mars 2015 - 12:30:44

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Christian Baudet, Miguel Galves, Zanoni Dias. Comparação de métodos para determinação de SNPs com medidas de confiabilidade. [Technical Report] 06-15, Instituto de Computação - UNICAMP. 2006. 〈hal-01092998〉

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