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Reports

Comparação de métodos para determinação de SNPs com medidas de confiabilidade

Résumé : Neste trabalho realizamos estudos sobre métodos para a identificação de polimorfismos de base única, comumente conhecidos pela sigla SNP (em inglês, Single Nucleotide Polymorphism). Identificar este tipo de polimorfismo é um processo importante pois, devido ao fato de eles poderem influenciar a estabilidade ou, até mesmo, a estrutura das proteínas codificadas pelos genes, os SNPs podem estar relacionados a diversas doenças. Um bom método de identificação deve ser capaz de apontar as posições polimórficas e fornecer uma medida de confiabilidade para a detecção realizada. Neste sentido, estudamos dois métodos: polybayes e MSASNP.O primeiro método trata-se de um programa que realiza análise bayesiana para análise das seqüências e identificação de SNPs. O segundo método adota uma estratégia simples, utilizando conceitos básicos de probabilidade. Os testes mostraram que o polybayes é o mais indicado por ser capaz de indentificar os SNPs e fornecer valores mais confiáveis sobre a probabilidade de detecção correta de um SNP.
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https://hal.inria.fr/hal-01092998
Contributor : Christian Baudet <>
Submitted on : Tuesday, December 9, 2014 - 9:54:20 PM
Last modification on : Friday, September 16, 2016 - 3:14:24 PM
Long-term archiving on: : Tuesday, March 10, 2015 - 12:30:44 PM

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06-15.pdf
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  • HAL Id : hal-01092998, version 1

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Christian Baudet, Miguel Galves, Zanoni Dias. Comparação de métodos para determinação de SNPs com medidas de confiabilidade. [Technical Report] 06-15, Instituto de Computação - UNICAMP. 2006. ⟨hal-01092998⟩

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