AnnotQTL: a new tool to gather functional and comparative information on a genomic region

Frédéric Lecerf; Anthony Bretaudeau; Olivier Sallou; Colette Désert; Yuna Blum; Sandrine Lagarrigue; Olivier Demeure

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AnnotQTL: a new tool to gather functional and comparative information on a genomic region

Frédéric Lecerf ¹ Anthony Bretaudeau ^{2, 3} Olivier Sallou ³ Colette Désert ¹ Yuna Blum ¹ Sandrine Lagarrigue ¹ Olivier Demeure ¹

1 GARen - Génétique Animale

2 SYMBIOSE - Biological systems and models, bioinformatics and sequences

IRISA - Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires, Inria Rennes – Bretagne Atlantique

3 Plateforme bioinformatique GenOuest [Rennes]

IRISA-D7 - GESTION DES DONNÉES ET DE LA CONNAISSANCE, UR1 - Université de Rennes 1, Plateforme Génomique Santé Biogenouest®, Inria Rennes – Bretagne Atlantique

Frédéric Lecerf ¹ AuthorId : 824954

Author Employer institution : AGROCAMPUS OUEST

Anthony Bretaudeau ^{2, 3} AuthorId : 613512

Author IdHAL : anthony-bretaudeau

Olivier Sallou ³ AuthorId : 613513

Author IdHAL : osallou

Colette Désert ¹ AuthorId : 823662

Author

Yuna Blum ¹ AuthorId : 613515

Author

Sandrine Lagarrigue ¹ AuthorId : 111731

Author Employer institution : AGROCAMPUS OUEST

Olivier Demeure ¹ AuthorId : 613517

Author

1 GARen - Génétique Animale (INRA-AGROCAMPUS-RENNES 65 rue de Saint-Brieuc 35042 RENNES - France) StructId : 16512

INRA - Institut National de la Recherche Agronomique : UMR598 (France) StructId : 92114
AGROCAMPUS OUEST (Institut Supérieur des Sciences Agronomiques, Agroalimentaires, Horticoles et du Paysage - 65, rue de St Brieuc - CS 84215 - 35042 Rennes cedex - France) StructId : 108028
- Institut Agro - Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (France) StructId : 1042499
Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Rennes (France) StructId : 300375

2 SYMBIOSE - Biological systems and models, bioinformatics and sequences (Campus de Beaulieu, 35042 Rennes cedex - France) StructId : 2535

IRISA - Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (Campus universitaire de Beaulieu - 35042 Rennes - France) StructId : 2494
- UR1 - Université de Rennes 1 (2 rue du Thabor - CS 46510 - 35065 Rennes cedex - France) StructId : 105160
  - UNIV-RENNES - Université de Rennes (France) StructId : 528860
- INSA Rennes - Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (20, avenue des Buttes de Coësmes - CS 70839 - 35708 Rennes cedex 7 - France) StructId : 117606
  - INSA - Institut National des Sciences Appliquées (France) StructId : 301232
  - UNIV-RENNES - Université de Rennes (France) StructId : 528860
- Inria - Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Domaine de Voluceau Rocquencourt - BP 105 78153 Le Chesnay Cedex - France) StructId : 300009
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR6074 (France) StructId : 441569
Inria Rennes – Bretagne Atlantique (Campus de beaulieu 35042 Rennes cedex - France) StructId : 419153
- Inria - Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Domaine de Voluceau Rocquencourt - BP 105 78153 Le Chesnay Cedex - France) StructId : 300009

3 Plateforme bioinformatique GenOuest [Rennes] (France) StructId : 191812

IRISA-D7 - GESTION DES DONNÉES ET DE LA CONNAISSANCE (France) StructId : 419370
- IRISA - Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (Avenue du général Leclerc Campus de Beaulieu 35042 RENNES CEDEX - France) StructId : 105128
  - INSA Rennes - Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (20, avenue des Buttes de Coësmes - CS 70839 - 35708 Rennes cedex 7 - France) StructId : 117606
    - INSA - Institut National des Sciences Appliquées (France) StructId : 301232
    - UNIV-RENNES - Université de Rennes (France) StructId : 528860
  - UBS - Université de Bretagne Sud (BP 92116 - 56321 Lorient cedex - France) StructId : 172265
  - CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR6074 (France) StructId : 441569
  - ENS Rennes - École normale supérieure - Rennes (Campus de Ker Lann - avenue Robert Schuman - 35170 Bruz - France) StructId : 247362
  - Inria - Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Domaine de Voluceau Rocquencourt - BP 105 78153 Le Chesnay Cedex - France) StructId : 300009
  - Télécom Bretagne (Technopôle Brest-Iroise CS 83818 29238 BREST Cedex 3 - France) StructId : 301262
  - UR1 - Université de Rennes 1 (2 rue du Thabor - CS 46510 - 35065 Rennes cedex - France) StructId : 105160
    - UNIV-RENNES - Université de Rennes (France) StructId : 528860
  - CentraleSupélec (3, rue Joliot Curie, Plateau de Moulon, 91192 GIF-SUR-YVETTE Cedex - France) StructId : 411575
UR1 - Université de Rennes 1 (2 rue du Thabor - CS 46510 - 35065 Rennes cedex - France) StructId : 105160
- UNIV-RENNES - Université de Rennes (France) StructId : 528860
Plateforme Génomique Santé Biogenouest® (France) StructId : 326388
Inria Rennes – Bretagne Atlantique (Campus de beaulieu 35042 Rennes cedex - France) StructId : 419153
- Inria - Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Domaine de Voluceau Rocquencourt - BP 105 78153 Le Chesnay Cedex - France) StructId : 300009

Keywords : Genomic regions QTL Gene ontology Annotation

Document type :

Poster communications

Domain :

Computer Science [cs] / Bioinformatics [q-bio.QM]

Complete list of metadatas

https://hal.inria.fr/hal-01102407
Contributor : Anthony Bretaudeau <>
Submitted on : Monday, January 12, 2015 - 4:40:16 PM
Last modification on : Monday, November 30, 2020 - 4:30:03 PM

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HAL Id : hal-01102407, version 1

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Frédéric Lecerf, Anthony Bretaudeau, Olivier Sallou, Colette Désert, Yuna Blum, et al.. AnnotQTL: a new tool to gather functional and comparative information on a genomic region. 12è Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques, Jun 2011, Paris, France. 2011. ⟨hal-01102407⟩

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