Passage à l’Échelle Mémoire et Impact des Allocations Dynamiques dans l’Application GYSELA

Fabien Rozar 1, 2, 3, *
Résumé : RÉSUMÉ. Les simulations gyrocinétiques nécessitent d'importants moyens de calcul. Jusqu'à présent, le code semi-Lagrangien GYSELA réalise des simulations sur quelques dizaines de milliers de coeurs de calcul (65k coeurs). Mais pour comprendre plus finement la nature de la turbulence des plasmas, nous devons raffiner la résolution de nos maillages, ce qui fera de GYSELA un candidat sérieux pour exploiter la puissance des futures machines de type Exas-cale. Le fait d'avoir moins de mémoire par coeur est une des difficultés majeures des machines envisagées pour l'Exascale. Cet article porte sur la réduction du pic mémoire. Il présente aussi une approche pour comprendre le comportement mémoire d'une application utilisant de très grands maillages. Ceci nous permet d'extrapoler dès maintenant le comportement de GYSELA sur des configurations de type Exascale. ABSTRACT. Gyrokinetic simulations lead to huge computational needs. Up to now, the Semi-Lagrangian code GYSELA performs large simulations using up to 65k cores. To understand more accurately the nature of plasma turbulence, finer resolutions are necessary which make GYSELA a good candidate to exploit the computational power of future Extreme scale machines. Among the Exascale challenges, the less memory per core is one of the most critical issues. This paper deals with memory management in order to reduce the memory peak and presents a general method to understand the memory behavior of an application when dealing with very large meshes. This enables us to extrapolate the behavior of GYSELA for expected capabilities of Extreme scale machines. MOTS-CLÉS : Exascale, Passage à l'échelle mémoire, Réduction de l'empreinte mémoire, Allocation dynamique, Physique des plasmas.
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Technique et Science Informatiques, Hermès-Lavoisier, 2015, Parallélisme, Architecture et Systèmes, 34 (1-2), pp.125-152. 〈http://tsi.revuesonline.com/article.jsp?articleId=21218〉. 〈10.3166/tsi.34.125-152〉
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Contributeur : Fabien Rozar <>
Soumis le : jeudi 16 juillet 2015 - 17:09:38
Dernière modification le : lundi 1 octobre 2018 - 16:03:08
Document(s) archivé(s) le : mercredi 26 avril 2017 - 05:40:23

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Fabien Rozar. Passage à l’Échelle Mémoire et Impact des Allocations Dynamiques dans l’Application GYSELA . Technique et Science Informatiques, Hermès-Lavoisier, 2015, Parallélisme, Architecture et Systèmes, 34 (1-2), pp.125-152. 〈http://tsi.revuesonline.com/article.jsp?articleId=21218〉. 〈10.3166/tsi.34.125-152〉. 〈hal-01176700〉

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