Structural conservation of remote homologues: better and further in contact fragments

Clovis Galiez 1 François Coste 1
1 Dyliss - Dynamics, Logics and Inference for biological Systems and Sequences
Inria Rennes – Bretagne Atlantique , IRISA-D7 - GESTION DES DONNÉES ET DE LA CONNAISSANCE
Abstract : We address here a basic question on sequence-structure relationships in proteins: does a protein sequence depict a structure with a uniform faithfulness all along the sequence ? We investigate this question by defining contact fragments and show that their sequence homologs are significantly more faithful to structure than randomly chosen fragments.
Type de document :
Communication dans un congrès
3DSIG: Structural Bioinformatics and Computational Biophysics, Jul 2015, Dublin, France
Liste complète des métadonnées

Littérature citée [2 références]  Voir  Masquer  Télécharger

https://hal.inria.fr/hal-01214506
Contributeur : François Coste <>
Soumis le : mardi 13 octobre 2015 - 17:23:38
Dernière modification le : mercredi 16 mai 2018 - 11:23:35
Document(s) archivé(s) le : jeudi 14 janvier 2016 - 10:40:44

Identifiants

  • HAL Id : hal-01214506, version 1

Citation

Clovis Galiez, François Coste. Structural conservation of remote homologues: better and further in contact fragments. 3DSIG: Structural Bioinformatics and Computational Biophysics, Jul 2015, Dublin, France. 〈hal-01214506〉

Partager

Métriques

Consultations de la notice

180

Téléchargements de fichiers

84