Programmes biochimiques et algorithmes mixtes analogiques-digitaux dans la cellule

Résumé : Dans ce chapitre nous adoptons un point de vue d'informaticien pour chercher à comprendre les calculs qu'effectue la cellule pour se maintenir dans son environnement, traiter les signaux qu'elle capte, et prendre les décisions qui déterminent son destin. L'aspect continu de beaucoup d'interactions protéiques nous conduit à considérer des modes de calcul mixtes analogiques-digitaux, pour lesquels des résultats récents en théorie de la calculabilité et de la complexité analogique établissent des liens fondamentaux avec la programmation classique. Nous dérivons de ces résultats un compilateur de spécifications comportementales en systèmes de réactions biochimiques que l'on peut comparer aux circuits naturels résultats de l'évolution. Nous illustrons cette démarche par l'exemple du module de signalisation MAPK qui a une fonction de convertisseur analogique-digital dans la cellule, et par le contrôle du cycle cellulaire.
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Thierry Gaudin; Dominique Lacroix; Marie-Christine Maurel; Jean-Charles Pomerol. Sciences de la vie, sciences de l’information, ISTE editions, 2017, Colloque de Cérisy, 978-1-78405-287-4. 〈http://www.ccic-cerisy.asso.fr/sciencesTM17.html〉
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Contributeur : François Fages <>
Soumis le : mardi 16 mai 2017 - 15:16:56
Dernière modification le : jeudi 30 novembre 2017 - 13:45:35
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François Fages, Guillaume Le Guludec. Programmes biochimiques et algorithmes mixtes analogiques-digitaux dans la cellule. Thierry Gaudin; Dominique Lacroix; Marie-Christine Maurel; Jean-Charles Pomerol. Sciences de la vie, sciences de l’information, ISTE editions, 2017, Colloque de Cérisy, 978-1-78405-287-4. 〈http://www.ccic-cerisy.asso.fr/sciencesTM17.html〉. 〈hal-01409743v3〉

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