La formation des transcrits à partir des gènes eucaryotes est due à un processus d’épissage alternatif qui sélectionne une partie des régions, les exons, dans lesquels certains seront traduits en protéines. Des partenaires de cette étude ont développé une méthode de prédiction des transcrits baptisée CG-Alcode, qui exploite le principe de conservation de séquences d’un même gène entre deux espèces (dits "gènes orthologues"). Ces travaux ont pour objectif d'étendre l'approche comparative pairwise à de la comparaison multi-espèces, en se basant sur trois espèces d’étude (homme, souris et chien). L’étude porte sur une cohorte de 2 167 triplets de gènes orthologues et est illustrée sur un gène en particulier : le gène CREM. Le protocole employé réinjecte les prédictions de transcrits d’un gène source exprimable chez un gène cible dans le répertoire de l’espèce cible. Cela vise à compléter les connaissances actuelles et à annoter le transcriptome des espèces, en particulier celui du chien encore peu documenté. 7 201 transcrits sont ainsi prédits. A partir de là, la construction de graphes de relations d’orthologie a été mise en place pour apporter une vision sur l’évolution des gènes et sur leurs transcrits exprimés. 83 triplets de gènes orthologues ont pu être retrouvés comme présentant une structure fine de gène identique entre les trois espèces, partagée depuis l’ancêtre Eutheria. Ces résultats montrent ainsi une première piste de compréhension en terme d'évolution (gain et de perte d’information) dans les structures de gènes.