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ELECTOR: evaluator for long reads correction methods
Camille Marchet
1, 2
Pierre Morisse
3
Lolita Lecompte
2
Arnaud Lefebvre
4
Thierry Lecroq
4
Pierre Peterlongo
2
Antoine Limasset
1
2
GenScale - Scalable, Optimized and Parallel Algorithms for Genomics
Inria Rennes – Bretagne Atlantique , IRISA-D7 - GESTION DES DONNÉES ET DE LA CONNAISSANCE
4
TIBS - LITIS - Equipe Traitement de l'information en Biologie Santé
LITIS - Laboratoire d'Informatique, de Traitement de l'Information et des Systèmes
Camille Marchet 1, 2
Author IdHAL : camille-marchet ORCID : https://orcid.org/0000-0002-7235-7346
Pierre Morisse 3
Author
Lolita Lecompte 2
Author IdHAL : lolita-lecompte ORCID : https://orcid.org/0000-0001-8773-6317
Arnaud Lefebvre 4
Author
Thierry Lecroq 4
Author IdHAL : thierry-lecroq ORCID : https://orcid.org/0000-0002-1900-3397
Pierre Peterlongo 2
Author IdHAL : pierre-peterlongo ORCID : https://orcid.org/0000-0003-0776-6407
Antoine Limasset 1
Author Employer institution : Centre National de la Recherche Scientifique IdHAL : antoine-limasset ORCID : https://orcid.org/0000-0002-0669-4141
1
CRIStAL - Centre de Recherche en Informatique, Signal et Automatique de Lille - UMR 9189 (Université de Lille - Campus Cité Scientifique - Bâtiment M3 - 59655 Villeneuve d'Ascq Cedex - FRANCE - France)
- Université de Lille : UMR9189 (Lille - France)
- Centrale Lille : UMR9189 (École Centrale de Lille - Cité Scientifique - CS 20048 59651 Villeneuve d'Ascq Cedex - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR9189 (France)
2
GenScale - Scalable, Optimized and Parallel Algorithms for Genomics (Campus de Beaulieu 35042 Rennes cedex - France)
- Inria Rennes – Bretagne Atlantique (Campus de beaulieu
35042 Rennes cedex - France)
- Inria - Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Domaine de Voluceau Rocquencourt - BP 105 78153 Le Chesnay Cedex - France)
- IRISA-D7 - GESTION DES DONNÉES ET DE LA CONNAISSANCE (France)
- IRISA - Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (Avenue du général Leclerc
Campus de Beaulieu
35042 RENNES CEDEX - France)
- UBS - Université de Bretagne Sud (BP 92116 - 56321 Lorient cedex - France)
- INSA Rennes - Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (20, avenue des Buttes de Coësmes - CS 70839 - 35708 Rennes cedex 7 - France)
- Inria - Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Domaine de Voluceau Rocquencourt - BP 105 78153 Le Chesnay Cedex - France)
- ENS Rennes - École normale supérieure - Rennes (Campus de Ker Lann - avenue Robert Schuman - 35170 Bruz - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR6074 (France)
- UR1 - Université de Rennes 1 (2 rue du Thabor - CS 46510 - 35065 Rennes cedex - France)
- UNIV-RENNES - Université de Rennes (France)
- CentraleSupélec (3, rue Joliot Curie, Plateau de Moulon, 91192 GIF-SUR-YVETTE Cedex - France)
- IMT Atlantique - IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (Campus Brest : Technopôle Brest-Iroise CS 8381829238 BREST Cedex 3 -
Campus Nantes : 4, rue Alfred Kastler- La chantrerie 44300 NANTES -
Campus Rennes : 2 Rue de la Châtaigneraie, 35510 CESSON SEVIGNE - France)
- IMT - Institut Mines-Télécom [Paris] (37-39 Rue Dareau, 75014 Paris - France)
- IRISA - Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (Avenue du général Leclerc
Campus de Beaulieu
35042 RENNES CEDEX - France)
3
LITIS - Laboratoire d'Informatique, de Traitement de l'Information et des Systèmes (Avenue de l'Université 76800 Saint-Étienne-du-Rouvray - France)
- INSA Rouen Normandie - Institut national des sciences appliquées Rouen Normandie (Avenue de l’Université 76801 Saint-Étienne-du-Rouvray Cedex - France)
- INSA - Institut National des Sciences Appliquées (France)
- NU - Normandie Université (Esplanade de la Paix - CS 14032 - 14032 Caen Cedex 5 - France)
- UNIROUEN - Université de Rouen Normandie : EA4108 (1, rue Thomas Becket 76821 Mont-Saint-Aignan Cedex - France)
- NU - Normandie Université (Esplanade de la Paix - CS 14032 - 14032 Caen Cedex 5 - France)
- ULH - Université Le Havre Normandie (25 rue Philippe Lebon - BP 1123 - 76063 Le Havre Cedex France - France)
- NU - Normandie Université (Esplanade de la Paix - CS 14032 - 14032 Caen Cedex 5 - France)
4
TIBS - LITIS - Equipe Traitement de l'information en Biologie Santé (France)
- LITIS - Laboratoire d'Informatique, de Traitement de l'Information et des Systèmes (Avenue de l'Université 76800 Saint-Étienne-du-Rouvray - France)
- INSA Rouen Normandie - Institut national des sciences appliquées Rouen Normandie (Avenue de l’Université 76801 Saint-Étienne-du-Rouvray Cedex - France)
- INSA - Institut National des Sciences Appliquées (France)
- NU - Normandie Université (Esplanade de la Paix - CS 14032 - 14032 Caen Cedex 5 - France)
- UNIROUEN - Université de Rouen Normandie : EA4108 (1, rue Thomas Becket 76821 Mont-Saint-Aignan Cedex - France)
- NU - Normandie Université (Esplanade de la Paix - CS 14032 - 14032 Caen Cedex 5 - France)
- ULH - Université Le Havre Normandie (25 rue Philippe Lebon - BP 1123 - 76063 Le Havre Cedex France - France)
- NU - Normandie Université (Esplanade de la Paix - CS 14032 - 14032 Caen Cedex 5 - France)
- INSA Rouen Normandie - Institut national des sciences appliquées Rouen Normandie (Avenue de l’Université 76801 Saint-Étienne-du-Rouvray Cedex - France)
Document type :
Journal articles
Domain :
Complete list of metadata
https://hal.inria.fr/hal-02371117
Contributor : Pierre Peterlongo Connect in order to contact the contributor
Submitted on : Tuesday, November 19, 2019 - 5:22:02 PM
Last modification on : Friday, January 21, 2022 - 3:11:54 AM
Contributor : Pierre Peterlongo Connect in order to contact the contributor
Submitted on : Tuesday, November 19, 2019 - 5:22:02 PM
Last modification on : Friday, January 21, 2022 - 3:11:54 AM
File
lqz015.pdf
Publication funded by an institution
Identifiers
- HAL Id : hal-02371117, version 1
- DOI : 10.1093/nargab/lqz015
Collections
LITIS | UNIV-RENNES1 | CRISTAL | CENTRALESUPELEC | INRIA | INSA-ROUEN | UNIV-RENNES | UNIROUEN | UNIV-LILLE | UNILEHAVRE | INSA-GROUPE | IRISA | COMUE-NORMANDIE | CNRS | UR1-MATH-STIC | UR1-UFR-ISTIC | CRISTAL-BONSAI | INSA-RENNES | UR1-MATH-NUM
Citation
Camille Marchet, Pierre Morisse, Lolita Lecompte, Arnaud Lefebvre, Thierry Lecroq, et al.. ELECTOR: evaluator for long reads correction methods. NAR Genomics and Bioinformatics, Oxford University Press, 2020, 2 (1), pp.1-12. ⟨10.1093/nargab/lqz015⟩. ⟨hal-02371117⟩
Metrics
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