Within-host genetic micro-diversity of Mycobacterium tuberculosis and the link with tuberculosis disease features
Charlotte Genestet
(1, 2)
,
Elisabeth Hodille
(1, 2)
,
François Massol
(3, 4)
,
Guislaine Refrégier
(5, 6)
,
Alexia Barbry
(1, 2)
,
Emilie Westeel
(1, 7)
,
Gérard Lina
(1, 2)
,
Florence Ader
(1, 8)
,
Laurent Jacob
(9, 10, 11, 12)
,
Stéphane Dray
(9)
,
Jean-Luc Berland
(1, 7)
,
Samuel Venner
(9)
,
Oana Dumitrescu
(1, 2)
1
CIRI -
Centre International de Recherche en Infectiologie
2 Laboratoire de Bactériologie de l'Hôpital de la Croix-Rousse
3 Evo-Eco-Paléo (EEP) - Évolution, Écologie et Paléontologie (Evo-Eco-Paleo) - UMR 8198
4 CIIL - Centre d’Infection et d’Immunité de Lille - INSERM U 1019 - UMR 9017 - UMR 8204
5 I2BC - Institut de Biologie Intégrative de la Cellule
6 ESE - Ecologie Systématique et Evolution
7 Fondation Mérieux
8 Service des Maladies Infectieuses et Tropicales [Lyon]
9 LBBE - Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive - UMR 5558
10 PEGASE - Département PEGASE [LBBE]
11 Baobab
12 ERABLE - Equipe de recherche européenne en algorithmique et biologie formelle et expérimentale
2 Laboratoire de Bactériologie de l'Hôpital de la Croix-Rousse
3 Evo-Eco-Paléo (EEP) - Évolution, Écologie et Paléontologie (Evo-Eco-Paleo) - UMR 8198
4 CIIL - Centre d’Infection et d’Immunité de Lille - INSERM U 1019 - UMR 9017 - UMR 8204
5 I2BC - Institut de Biologie Intégrative de la Cellule
6 ESE - Ecologie Systématique et Evolution
7 Fondation Mérieux
8 Service des Maladies Infectieuses et Tropicales [Lyon]
9 LBBE - Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive - UMR 5558
10 PEGASE - Département PEGASE [LBBE]
11 Baobab
12 ERABLE - Equipe de recherche européenne en algorithmique et biologie formelle et expérimentale
Charlotte Genestet
- Fonction : Auteur
- PersonId : 768898
- ORCID : 0000-0001-6846-4053
- IdRef : 202957837
Elisabeth Hodille
- Fonction : Auteur
- PersonId : 778053
- ORCID : 0000-0002-5144-1987
François Massol
- Fonction : Auteur
- PersonId : 177292
- IdHAL : francois-massol
- ORCID : 0000-0002-4098-955X
- IdRef : 124966772
Guislaine Refrégier
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1295408
- IdHAL : guislaine-refregier
Gérard Lina
- Fonction : Auteur
- PersonId : 758186
- ORCID : 0000-0002-9236-7998
- IdRef : 066862558
Laurent Jacob
- Fonction : Auteur
- PersonId : 21877
- IdHAL : laurent-jacob
- ORCID : 0000-0002-7826-2719
- IdRef : 176737952
Jean-Luc Berland
- Fonction : Auteur
- PersonId : 771243
- ORCID : 0000-0002-6337-3715
Samuel Venner
- Fonction : Auteur
- PersonId : 169588
- IdHAL : samuel-venner
- ORCID : 0000-0001-7127-3733
- IdRef : 070402167
Oana Dumitrescu
- Fonction : Auteur
- PersonId : 771089
- ORCID : 0000-0001-8193-1437
- IdRef : 116532734
Résumé
Tuberculosis (TB), caused by Mycobacterium tuberculosis (Mtb) complex, is still the number one deadly contagious disease. Mtb infection results in a wide spectrum of clinical presentations and severity symptoms, but without proven Mtb genetic determinants. Thanks to a collection of 355 clinical isolates with associated patient’s clinical data, we showed that Mtb micro-diversity within patient isolates is strongly correlated with TB-associated severity scores. Interestingly, this diversity is driven by a selection pressure to adapt to different lifestyles related to the infection site. Taken together, these results provide a new insight to better understand TB pathophysiology. Furthermore, Mtb micro-diversity could be envisioned as a new prognostic tool to improve the management of TB patients.