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Conference papers

Traitement statistique des résultats SELEX

Damien Eveillard 1, 2 Yann Guermeur 1
1 MODBIO - Computational models in molecular biology
INRIA Lorraine, LORIA - Laboratoire Lorrain de Recherche en Informatique et ses Applications
Résumé : Les expériences de SELEX constituent une source d'informations particulièrement précieuse en biologie moléculaire. Cependant, les données produites, qui peuvent présenter une variabilité importante, ne sont pas d'une exploitation aisée. Après avoir mis en lumière le fait que l'approche standard de cette exploitation peut conduire à des résultats incomplets, voire erronés, cet article propose de pallier les insuffisances rencontrées en introduisant une étape de traitement supplémentaire, de nature statistique. Cette étape, qui a pour but d'identifier le nombre de motifs à déterminer, ainsi que les ensembles de ligands qui leur sont associés, repose sur l'analyse de données et la classification. Elle précède la détermination des séquences consensus. Notre approche est validée sur un cas réel, pour lequel elle produit des résultats permettant de formuler des hypothèses confirmées a posteriori par une étude biologique indépendante de la nôtre.
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https://hal.inria.fr/inria-00000918
Contributor : Damien Eveillard Connect in order to contact the contributor
Submitted on : Thursday, December 8, 2005 - 7:03:58 PM
Last modification on : Friday, February 4, 2022 - 3:21:41 AM

Identifiers

  • HAL Id : inria-00000918, version 1

Citation

Damien Eveillard, Yann Guermeur. Traitement statistique des résultats SELEX. Journées Ouvertes en Biologie Informatiques et Mathématiques - JOBIM 2002, Jacques Nicolas & Claude Thermes, Jun 2002, Saint Malo - France, pp.277--283. ⟨inria-00000918⟩

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