Fouille de données à l'aide de HMM : Application à la détection de réitérations intragénomiques - Inria - Institut national de recherche en sciences et technologies du numérique Accéder directement au contenu
Communication Dans Un Congrès Année : 2002

Fouille de données à l'aide de HMM : Application à la détection de réitérations intragénomiques

Bertrand Aigle
Bernard Decaris
  • Fonction : Auteur
Pierre Leblond

Résumé

Nous présentons une méthode de fouille de données génomiques dans laquelle l'utilisateur analyse un signal élaboré pour la circonstance par un HMM d'ordre deux. Ce signal, qui représente une probabilité a posteriori de classer un résidu ou un groupe de résidus nucléotidiques dans un état, permet la localisation de répétitions dans la séquence d'un génome bactérien complet.

Domaines

Autre [cs.OH]
Fichier non déposé

Dates et versions

inria-00100752 , version 1 (26-09-2006)

Identifiants

  • HAL Id : inria-00100752 , version 1

Citer

Sébastien Hergalant, Bertrand Aigle, Bernard Decaris, Pierre Leblond, Jean-François Mari. Fouille de données à l'aide de HMM : Application à la détection de réitérations intragénomiques. Journées Ouvertes Biologie Informatique Mathématiques - JOBIM'02, François Coste - Elisabeth Lebret, 2002, Saint Malo, France, pp.269-273. ⟨inria-00100752⟩
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