Collecte et intégration de données biologiques hétérogènes sur le web : application dans le domaine de la cartographie du génome humain

Marie-Dominique Devignes 1 André Schaaff Malika Smaïl 1
1 LANGUE ET DIALOGUE - Human-machine dialogue with a significant language component
INRIA Lorraine, LORIA - Laboratoire Lorrain de Recherche en Informatique et ses Applications
Résumé : La réponse à une question biologique donnée nécessite souvent l'interrogation de multiples ressources réparties et accessibles par le web. Le travail présenté ici s'inscrit dans le cadre de l'intégration de sources hétérogènes structurées en prenant en compte les spécificités identifiées des sources de données biologiques. Les problèmes rencontrés ont été analysés pour rechercher les pathologies orphelines co-localisées avec un gène d'intérêt. Le scénario de recherche d'information a été formalisé et un modèle générique est proposé pour l'interrogation des sources. Une DTD XML nous permet de représenter les données collectées. Ces propositions ont donné lieu à deux prototypes, Xmap_INTERACTIF et Xmap_AUTO. Les résultats d'un test impliquant 164 gènes sont analysés. || Answering biological questions frequently requires multiple queries through various sources disseminated on the web. The context of the work presented here is integration of heterogeneous data sources taking into account specificities of biological source
Mots-clés : cartographie des gènes humains intégration de sources de données hétérogènes pathologies orphelines documents structurés
Type de document :
Article dans une revue
Revue des Sciences et Technologies de l'Information - Série ISI : Ingénierie des Systèmes d'Information, Lavoisier, 2002, 7 (1-2), pp.45-61
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Soumis le : mardi 26 septembre 2006 - 14:51:06
Dernière modification le : jeudi 11 janvier 2018 - 06:19:48

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Marie-Dominique Devignes, André Schaaff, Malika Smaïl. Collecte et intégration de données biologiques hétérogènes sur le web : application dans le domaine de la cartographie du génome humain. Revue des Sciences et Technologies de l'Information - Série ISI : Ingénierie des Systèmes d'Information, Lavoisier, 2002, 7 (1-2), pp.45-61. 〈inria-00100799〉

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