Classification et interrogation de sources de données biologiques

Nizar Messai; Marie-Dominique Devignes; Amedeo Napoli; Malika Smaïl-Tabbone

Classification et interrogation de sources de données biologiques

Nizar Messai ¹ Marie-Dominique Devignes ¹ Amedeo Napoli ¹ Malika Smaïl-Tabbone ¹

1 ORPAILLEUR - Knowledge representation, reasonning

INRIA Lorraine, LORIA - Laboratoire Lorrain de Recherche en Informatique et ses Applications

Résumé : Nous présentons une méthode de classification et de recherche de sources biologiques. Elle consiste à construire un treillis de Galois à partir d'un ensemble de méta-données associées aux sources et converties en propriétés booléennes. Un concept construit à partir d'une requête utilisateur est ensuite inséré dans le treillis grâce à un algorithme de construction incrémentale. Le calcul du résultat se ramène à extraire l'ensemble des sources figurant dans les extensions des subsumants du concept requête dans le treillis de Galois résultant. L'ordre de pertinence des sources est déduit à partir de l'ordre de subsumption des concepts correspondants dans le treillis. Une amélioration de la méthode consiste à enrichir la requête à partir d'ontologies de domaine avant de l'insérer dans le treillis. Deux modes d'enrichissement sont possibles: l'enrichissement par généralisation et l'enrichissement par spécialisation.

Document type :

Journal articles

Domain :

Computer Science [cs] / Symbolic Computation [cs.SC]

Complete list of metadatas

https://hal.inria.fr/inria-00103937
Contributor : Nizar Messai <>
Submitted on : Thursday, October 5, 2006 - 3:15:44 PM
Last modification on : Thursday, January 11, 2018 - 6:19:53 AM
Long-term archiving on : Saturday, May 14, 2011 - 12:05:56 AM

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