Logol : Modelling evolving sequence families through a dedicated constrained string language

Catherine Belleannée 1 Jacques Nicolas 1
1 SYMBIOSE - Biological systems and models, bioinformatics and sequences
IRISA - Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires, Inria Rennes – Bretagne Atlantique
Abstract : The report reviews the key milestones that have been reached so far in applying formal languages to the analysis of genomic sequences. Then it introduces a new modelling language, Logol, that aims at expressing more easily complex structures on genomic sequences. It is based on a development of String Variable Grammars, a formal framework proposed by D. Searls.
Type de document :
Rapport
[Research Report] RR-6350, INRIA. 2007, pp.19
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Contributeur : Catherine Belleannée <>
Soumis le : jeudi 15 novembre 2007 - 09:02:31
Dernière modification le : mercredi 16 mai 2018 - 11:23:05
Document(s) archivé(s) le : vendredi 25 novembre 2016 - 16:57:20

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Citation

Catherine Belleannée, Jacques Nicolas. Logol : Modelling evolving sequence families through a dedicated constrained string language. [Research Report] RR-6350, INRIA. 2007, pp.19. 〈inria-00186568v3〉

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