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Conference papers

Recherche d'une signature proteomique du cancer du poumon.

Cécile Amblard 1 Sylvie Michelland 2 Florence de Fraipont 2 Denis Moro-Sibilot 3 François Godard 2 Marie-Christine Favrot 2 Michel Seve 2
1 TIMB
TIMC-IMAG - Techniques de l'Ingénierie Médicale et de la Complexité - Informatique, Mathématiques et Applications, Grenoble - UMR 5525
Résumé : Ce travail est consacré à la recherche d'une signature protéomique du cancer du poumon. A partir de spectres acquis avec un spectromêtre de masse SELDI, nous recherchons un ensemble de protéines permettant de discriminer les patients atteints d'un cancer du poumon des sujets sains. Le problème est difficle en particulier parce qu'il y a plus de protéines que de patients et parce qu'il y a une grande variabilité dans les spectres d'une même population. Nous cherchons aussi à nous affranchir des effets de l'âge et du sexe. Nous avons choisi d'utiliser Random Forest. Cette méthode de classification naturellement multivariée, permettant d'identifier les variables discriminantes et étant capable de travailler avec plus de variables que d'échantillons nous semble bien adaptée au problème posé. Nous avons ainsi trouvé un ensemble de protéines discriminantes dont certaines ont pu être identifiées.
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https://hal.inria.fr/inria-00386671
Contributor : Conférence Jds2009 <>
Submitted on : Friday, May 22, 2009 - 9:11:55 AM
Last modification on : Wednesday, June 23, 2021 - 11:18:01 AM
Long-term archiving on: : Thursday, June 10, 2010 - 11:37:09 PM

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  • HAL Id : inria-00386671, version 1

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Cécile Amblard, Sylvie Michelland, Florence de Fraipont, Denis Moro-Sibilot, François Godard, et al.. Recherche d'une signature proteomique du cancer du poumon.. 41èmes Journées de Statistique, SFdS, Bordeaux, 2009, Bordeaux, France, France. ⟨inria-00386671⟩

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