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Conference papers

Nouvelle méthode statistique pour l'analyse de données de ChIP-chip

Résumé : La méthode de Chromatin ImmunoPrecipitation on chip (ChIP on chip ou ChIP-chip) a pour but de détecter les sites de fixation des protéines (généralement des facteurs de transcription) sur la molécule d'ADN. L'analyse statistique des données consiste a rechercher des régions de pics significatifs synonymes de sites de fixation. La méthode que nous avons élaborée est issue de la théorie des valeurs extrêmes et particulièrement de la méthode POT (Peaks Over Threshold). Cette méthode consiste à modéliser les données de queues de distribution, en ne retenant que les valeurs dépassant un certain seuil, elle a la particularité de modéliser d'une part les intensités de dépassement de seuil, mais aussi les positions d'occurrences de ces dépassements de seuil. Cette méthode va nous permettre de déterminer un seuil au delà duquel les pics pourront être considérés comme significatifs.
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https://hal.inria.fr/inria-00386766
Contributor : Conférence Jds2009 <>
Submitted on : Friday, May 22, 2009 - 9:19:21 AM
Last modification on : Tuesday, February 2, 2021 - 2:38:01 PM
Long-term archiving on: : Thursday, June 10, 2010 - 9:42:25 PM

File

p206.pdf
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Identifiers

  • HAL Id : inria-00386766, version 1

Citation

Florian Salipante, Christelle Reynes, Laurent Journot, Robert Sabatier. Nouvelle méthode statistique pour l'analyse de données de ChIP-chip. 41èmes Journées de Statistique, SFdS, Bordeaux, 2009, Bordeaux, France, France. ⟨inria-00386766⟩

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