Nouvelle méthode statistique pour l'analyse de données de ChIP-chip

Résumé : La méthode de Chromatin ImmunoPrecipitation on chip (ChIP on chip ou ChIP-chip) a pour but de détecter les sites de fixation des protéines (généralement des facteurs de transcription) sur la molécule d'ADN. L'analyse statistique des données consiste a rechercher des régions de pics significatifs synonymes de sites de fixation. La méthode que nous avons élaborée est issue de la théorie des valeurs extrêmes et particulièrement de la méthode POT (Peaks Over Threshold). Cette méthode consiste à modéliser les données de queues de distribution, en ne retenant que les valeurs dépassant un certain seuil, elle a la particularité de modéliser d'une part les intensités de dépassement de seuil, mais aussi les positions d'occurrences de ces dépassements de seuil. Cette méthode va nous permettre de déterminer un seuil au delà duquel les pics pourront être considérés comme significatifs.
Type de document :
Communication dans un congrès
41èmes Journées de Statistique, SFdS, Bordeaux, 2009, Bordeaux, France, France. 2009
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Contributeur : Conférence Jds2009 <>
Soumis le : vendredi 22 mai 2009 - 09:19:21
Dernière modification le : lundi 14 mai 2018 - 17:28:01
Document(s) archivé(s) le : jeudi 10 juin 2010 - 21:42:25

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Florian Salipante, Christelle Reynes, Laurent Journot, Robert Sabatier. Nouvelle méthode statistique pour l'analyse de données de ChIP-chip. 41èmes Journées de Statistique, SFdS, Bordeaux, 2009, Bordeaux, France, France. 2009. 〈inria-00386766〉

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