Protein Threading

Guillaume Collet 1 Rumen Andonov 1 Nicola Yanev 1 Jean-François Gibrat 2
1 SYMBIOSE - Biological systems and models, bioinformatics and sequences
IRISA - Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires, Inria Rennes – Bretagne Atlantique
Abstract : This paper describes a new algorithm that expands upon algorithms proposed in previous works to allow implementation of local sequence – structure alignments for the protein threading problem. This allows threading methods to cover the whole spectrum of alignment types needed to analyze homologous proteins.
Type de document :
Communication dans un congrès
8th Cologne-Twente Workshop on Graphs and Combinatorial Optimization, Jun 2009, Paris, France. 2009
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Contributeur : Guillaume Collet <>
Soumis le : mercredi 2 septembre 2009 - 13:11:53
Dernière modification le : jeudi 11 janvier 2018 - 06:20:10
Document(s) archivé(s) le : mardi 15 juin 2010 - 23:04:50

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Guillaume Collet, Rumen Andonov, Nicola Yanev, Jean-François Gibrat. Protein Threading. 8th Cologne-Twente Workshop on Graphs and Combinatorial Optimization, Jun 2009, Paris, France. 2009. 〈inria-00412642〉

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