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Détoxication et réparation tissulaire
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Informatique, Biologie Intégrative et Systèmes Complexes
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hal-01350190
v1
Article dans une revue
Jacques Nicolas
.
Décoder le vivant
Interstices
, INRIA, 2010,
<https://interstices.info/jcms/n_50779/decoder-le-vivant>
hal-00015234
v1
Article dans une revue
Jacques Nicolas
,
Patrick Durand
,
Grégory Ranchy
,
Sébastien Tempel
,
Anne-Sophie Valin
.
Suffix-Tree Analyser (STAN): looking for nucleotidic and peptidic patterns in genomes
Bioinformatics (Oxford, England)
, 2005, 21(24), pp.4408-4410
hal-00015261
v1
Communication dans un congrès
Sébastien Tempel
,
Mathieu Giraud
,
Israël-César Lerman
,
Ivan Couée
,
Abdelhak El Amrani
et al.
Organisation modulaire des séquences d'ADN répétées: application à l'étude des hélitrons non-autonomes dans le génome d'Arabidopsis thaliana
XIIIe colloque Eléments Transposables
, 2005, Orsay, France. 2005, 4-6/07/2005
tel-00355156
v1
HDR
Jacques Nicolas
.
Syntaxe, raisonnement et génomes
Sciences du Vivant [q-bio]. Université Rennes 1, 2008
inria-00073427
v1
Rapport
Christine Sinoquet
,
Jacques Nicolas
.
Analyse syntaxique non déterministe utilisant un modèle de n-grams
[Rapport de recherche] RR-3262, INRIA. 1997
inria-00073042
v1
Rapport
Jacques Nicolas
.
Grammatical Inference as Unification
[Research Report] RR-3632, INRIA. 1999
inria-00425373
v1
Communication dans un congrès
Pierre Peterlongo
,
Jacques Nicolas
,
Dominique Lavenier
,
Raoul Vorc'H
,
Joël Querellou
.
c-GAMMA: Comparative Genome Analysis of Molecular Markers
LNCS.
Pattern Recognition in Bioinformatics
, Sep 2009, Sheffield, United Kingdom. SpringerLink, 5780/2009, pp.255-269, 2009, Pattern Recognition in Bioinformatics.
<10.1007/978-3-642-04031-3_23>
hal-00090517
v1
Article dans une revue
Sébastien Tempel
,
Mathieu Giraud
,
Dominique Lavenier
,
Israël-César Lerman
,
Anne-Sophie Valin
et al.
Domain organization within repeated DNA sequences: application to the study of a family of transposable elements.
Bioinformatics (Oxford, England)
, 2006, 22(16), pp.1948-1954
hal-01059506
v1
Communication dans un congrès
Catherine Belleannée
,
Olivier Sallou
,
Jacques Nicolas
.
Logol: Expressive Pattern Matching in sequences. Application to Ribosomal Frameshift Modeling
Comin, Matteo; Kall, Lukas; Marchiori, Elena; Ngom, Alioune; Rajapakse, Jagath.
PRIB2014 - Pattern Recognition in Bioinformatics, 9th IAPR International Conference
, Aug 2014, Stockholm, Sweden. Springer International Publishing, 8626, pp.34-47, 2014,
<10.1007/978-3-319-09192-1_4>
hal-01063727
v1
Communication dans un congrès
François Coste
,
Gaëlle Garet
,
Agnès Groisillier
,
Jacques Nicolas
,
Thierry Tonon
.
Automated Enzyme classification by Formal Concept Analysis
ICFCA - 12th International Conference on Formal Concept Analysis
, Jun 2014, Cluj-Napoca, Romania. Springer, 2014
hal-00730207
v1
Chapitre d'ouvrage
Jacques Nicolas
.
To detect and analyze sequence repeats whatever be their origin
Yves Bigot.
Mobile genetic elements : protocols and genomic applications
, 859, Springer, pp.69-90, 2012, Springer Protocols, 978-1-61779-602-9.
<10.1007/978-1-61779-603-6>
hal-00730553
v1
Communication dans un congrès
François Coste
,
Gaelle Garet
,
Jacques Nicolas
.
Local Substitutability for Sequence Generalization
Jeffrey Heinz and Colin de la Higuera and Tim Oates.
ICGI 2012
, Sep 2012, Washington, United States. MIT Press, 21, pp.97-111, 2012, JMLR Workshop and Conference Proceedings; Proceedings of the Eleventh International Conference on Grammatical Inference.
<http://jmlr.csail.mit.edu/proceedings/papers/v21/coste12a/coste12a.pdf>
inria-00353690
v1
Rapport
Jacques Nicolas
,
Christine Rousseau
,
Anne Siegel
,
Pierre Peterlongo
,
François Coste
et al.
Modeling local repeats on genomic sequences
[Research Report] RR-6802, INRIA. 2008, pp.43
inria-00611457
v1
Communication dans un congrès
Mathilde Le Boudic-Jamin
,
Noël Malod-Dognin
,
Alexandre Cornu
,
Jacques Nicolas
,
Rumen Andonov
.
Identification rapide de familles protéiques par dominance
12th Annual Congress of the French National Society of Operations Research and Decision Science (ROADEF)
, Mar 2011, Saint-Étienne, France. 2, pp.791-792, 2011
inria-00186568
v3
Rapport
Catherine Belleannée
,
Jacques Nicolas
.
Logol : Modelling evolving sequence families through a dedicated constrained string language
[Research Report] RR-6350, INRIA. 2007, pp.19
inria-00435823
v1
Communication dans un congrès
Fabrice Legeai
,
Jean-Pierre Gauthier
,
François Cousserans
,
Emmanuelle D'Alençon
,
Olivier Collin
et al.
From AphidBase and Lepido-DB to an Information System for Insect Plant pest genomics studies.
1st Workshop on Information System for Insect Pest
, Nov 2009, Rennes, France. 2009
hal-00186471
v1
Communication dans un congrès
Philippe Veber
,
Sébastien Tempel
,
Rumen Andonov
,
Dominique Lavenier
,
Jacques Nicolas
.
Détection de domaines dans des séquences génomiques : un problème de couverture optimale
FRANCORO V/ROADEF 2007
, Feb 2007, Grenoble, France
hal-00643408
v1
Rapport
Christophe Vroland
,
Catherine Belleannée
,
Jacques Nicolas
.
Recherche et annotation des structures de CRISPR dans l'ensemble des génomes procaryotes
[Rapport de recherche] PI-1986, 2011, pp.24
inria-00536680
v1
Communication dans un congrès
Lazaros Mavridis
,
Vishwesh Venkatraman
,
David Ritchie
,
H. Morikawa
,
Rumen Andonov
et al.
SHREC'10 Track: Protein Models
Eurographics Workshop on 3D Object Retrieval - 3DOR 2010
, May 2010, Norrköping, Sweden. 2010
inria-00438517
v1
Article dans une revue
Jacques Nicolas
.
Décoder le vivant
Doc Sciences
, Édition du CRDP de l'académie de Versailles, 2009, Le numérique et les sciences du vivant, pp.26-33
hal-00107100
v1
Article dans une revue
Pascale Quignon
,
Mathieu Giraud
,
Maud Rimbault
,
Patricia Lavigne
,
Sandrine Tacher
et al.
The dog and rat olfactory receptor repertoires
Genome Biology
, BioMed Central, 2005, 6 (10), pp.R83.
<10.1186/gb-2005-6-10-r83>
hal-00667141
v1
Communication dans un congrès
Frédéric Bourgeon
,
Jacques Nicolas
,
Nathalie Melaine
,
Charles Pineau
.
Identification and characterization of novel anti-infectious peptides from the male genital tract.
34th Federation of European Biochemical Societies (FEBS) Congress
, Jul 2009, Prague, Czech Republic
inria-00070303
v1
Rapport
Maximilian Häußler
,
Jacques Nicolas
.
Motif Discovery on Promotor Sequences
[Research Report] RR-5714, INRIA. 2005, pp.136
hal-00129758
v1
Autre publication
Patrick Durand
,
Frédéric Mahé
,
Anne-Sophie Valin
,
Jacques Nicolas
.
Pyramid diagram: visualizing the organization of repetitive sequences in genomes.
FR2116. Rapport de recherche n°5798 Projet Symbiose. 2005
inria-00537927
v1
Communication dans un congrès
Fabrice Legeai
,
Guillaume Rizk
,
T. Walsh
,
Owain Edwards
,
Jacques Nicolas
et al.
Prediction and analyzes of non coding RNA sequences in the pea aphid genome
Arthropods Genomics
, Jun 2010, Kansas City, United States. 2010
inserm-00482283
v1
Article dans une revue
Fabrice Legeai
,
Guillaume Rizk
,
Thomas Walsh
,
Owain Edwards
,
Karl Gordon
et al.
Bioinformatic prediction, deep sequencing of microRNAs and expression analysis during phenotypic plasticity in the pea aphid, Acyrthosiphon pisum.
BMC Genomics
, BioMed Central, 2010, 11 (1), pp.281.
<10.1186/1471-2164-11-281>
hal-00129773
v1
Article dans une revue
Patrick Durand
,
Frédéric Mahé
,
Anne-Sophie Valin
,
Jacques Nicolas
.
Browsing repeats in genomes : Pygram and an application to non-coding region analysis.
BMC Bioinformatics
, BioMed Central, 2006, 7, 477 (17p.)
inria-00536742
v1
Article dans une revue
Sebastien Tempel
,
Christine Rousseau
,
Fariza Tahi
,
Jacques Nicolas
.
ModuleOrganizer: detecting modules in families of transposable elements.
BMC Bioinformatics
, BioMed Central, 2010, 11, pp.474.
<10.1186/1471-2105-11-474>
hal-00924413
v1
Communication dans un congrès
Valentin Wucher
,
Denis Tagu
,
Jacques Nicolas
.
Edge Selection in a Noisy Graph by Concept Analysis: Application to a Genomic Network
ECDA - European Conference on Data Analysis - 2013
, Jul 2013, Luxembourg, Luxembourg. 2013
hal-01100051
v1
Article dans une revue
Jacques Nicolas
,
Catherine Belleannée
,
François Coste
.
Le langage des molécules du vivant
Bibliothèque Tangente
, Editions Pôle Paris, 2014, pp.8
1
2
Tri
Pertinence
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Auteur Z→A
Titre A→Z
Titre Z→A
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