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hal-00828841v1  Communication dans un congrès
Gaëtan Louarn, Serge Carré, Frédéric Boudon, Annie Eprinchard, Didier Combes. Characterization of whole plant leaf area properties using laser scanner point clouds
Fourth International Symposium on Plant Growth Modeling, Simulation, Visualization and Applications, 2012, Shanghai, China. 2012
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halshs-00750971v1  Article dans une revue
Cédric Gaucherel, Frédéric Boudon, Thomas Houet, Mathieu Castets, Christophe Godin. Understanding patchy landscape dynamics: Towards a landscape language
PLoS ONE, Public Library of Science, 2012, 7 (9), pp.16. <10.1371/journal.pone.0046064>
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cirad-00703085v1  Article dans une revue
Frédéric Boudon, Christophe Pradal, Thomas Cokelaer, Przemyslaw Prusinkiewicz, Christophe Godin. L-Py: an L-system simulation framework for modeling plant architecture development based on a dynamic language
Frontiers in Plant Science, Frontiers, 2012, 3 (76), doi: 10.3389/fpls.2012.00076. <10.3389/fpls.2012.00076>
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lirmm-01052546v1  Poster
Emmanuel Castanier, Clement Jonquet, Soumia Melzi, Pierre Larmande, Manuel Ruiz et al.  Semantic Annotation Workflow using Bio-Ontologies
Workshop on Crop Ontology and Phenotyping Data Interoperability, Mar 2014, Montpellier, France. 2014, <https://sites.google.com/a/cgxchange.org/cropontologycommunity/>
lirmm-01274884v1  Communication dans un congrès
Aravind Venkatesan, Nordine El Hassouni, Florian Philippe, Cyril Pommier, Hadi Quesneville et al.  Exposing French agronomic resources as Linked Open Data
SWAT4LS: Semantic Web Applications and Tools for Life Sciences, Dec 2015, Cambridge, United Kingdom. 1546, 2015, <http://ceur-ws.org/Vol-1546/>
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hal-01427737v1  Chapitre d'ouvrage
Gildas Tagny Ngompé, Aravind Venkatesan, Nordine Hassouni, Manuel Ruiz, Pierre Larmande. AgroLD API Une architecture orientée services pour l'extraction de connaissances dans la base de données liées AgroLD
Ingénierie des systèmes d’information , 21 (5-6), lavoisier, pp.133-158, 2016, Web de données : publication, liage et capitalisation, <10.3166/ISI.21.5-6.133-158>. <http://isi.revuesonline.com/>
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hal-00850801v1  Communication dans un congrès
Mikolaj Cieslak, M. Génard, Frédéric Boudon, Valentina Baldazzi, Christophe Godin et al.  Integrating architecture and physiological perspectives in fruit development
Risto Sievänen and Eero Nikinmaa and Christophe Godin and Anna Lintunen and Pekka Nygren. 7th International Conference on Functional-Structural Plant Models, Jun 2013, Saariselkä, Finland. pp.127-130, 2013, Proceedings of the 7th International Conference on Functional-Structural Plant Models. <http://www.metal.fi/fspm2013/proceedings>
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hal-01411713v1  Communication dans un congrès
Stella Zevio, Nordine El Hassouni, Manuel Ruiz, Pierre Larmande. AgroLD indexing tools with ontological annotations
Semantic Web for Life Science - SWA4LS, Dec 2016, Amsterdam, Netherlands. 2016, <http://www.swat4ls.org/>
hal-01088822v1  Communication dans un congrès
Julien Champ, Alexis Joly, Bonnet Pierre. Fine-grained Visual Faceted Search
ACM Multimedia, Nov 2014, Orlando, FL, United States. The 22nd ACM International Conference on Multimedia - November 3-7, 2014 | Orlando, FL, USA, <http://dl.acm.org/citation.cfm?id=2654875>. <10.1145/2647868.2654875>
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hal-00931231v1  Chapitre d'ouvrage
Jérôme Guénard, Géraldine Morin, Frédéric Boudon, Vincent Charvillat. Reconstructing Plants in 3D from a Single Image Using Analysis-by-Synthesis
Bebis, George and Boyle, Richard and Parvin, Bahram and Koracin, Darko and Li, Baoxin and Porikli, Fatih and Zordan, Victor and Klosowski, James and Coquillart, Sabine and Luo, Xun and Chen, Min and Gotz, David. Advances in Visual Computing, 8033, Springer Berlin Heidelberg, pp.322--332, 2013, Lecture Notes in Computer Science, 978-3-642-41913-3. <10.1007/978-3-642-41914-0_32>
hal-01512024v1  Article dans une revue
Garance Koch, Anaëlle Dambreville, Gaelle Rolland, Myriam Dauzat, Christian Chevalier et al.  A multi-scale pipeline for reproducible analyses of tomato leaf expansion and its plasticity
Acta Horticulturae, International Society for Horticultural Science, 2016, in press
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hal-00831782v1  Article dans une revue
Etienne Farcot, Jean-Luc Gouzé. Limit cycles in piecewise-affine gene network models with multiple interaction loops
International Journal of Systems Science, Taylor & Francis, 2010, 41 (1), pp.119-130. <10.1080/00207720903144552>
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hal-00828843v1  Communication dans un congrès
Mikolaj Cieslak, Frédéric Boudon, Samir Kenouche, Michel Zanca, Christophe Goze-Bac et al.  Generating 3D volumetric meshes of internal and external fruit structure
HortiModel2012 -- Models for Plant Growth, Environmental Control and Farm Management in Protected Cultivation. Acta Horticulturae., 2012, Nanjing, China. International Society for Horticultural Science, 978-90-66055-15-5, 957, 2012, Acta Horticulturae
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hal-01361020v1  Article dans une revue
Jonathan Legrand, Jean-Benoist Leger, Stephane Robin, Teva Vernoux, Yann Guédon. Modelling the influence of dimerisation sequence dissimilarities on the auxin signalling network
BMC Systems Biology, BioMed Central, 2016, 10 (22), pp.17. <10.1186/s12918-016-0254-7>
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hal-01089744v1  Chapitre d'ouvrage
Jérôme Guénard, Géraldine Morin, Frédéric Boudon, Vincent Charvillat. Realistic Plant Modeling from Images Based on Analysis-by-Synthesis
Floater, Michael and Lyche, Tom and Mazure, Marie-Laurence and Mørken, Knut and Schumaker, LarryL. Mathematical Methods for Curves and Surfaces, 8177, Springer-Verlag, pp.213-229, 2014, Lecture Notes in Computer Science, 978-3-642-54381-4. <10.1007/978-3-642-54382-1_12>
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tel-00859843v1  Thèse
Chakkrit Preuksakarn. Reconstructing plant architecture from 3D laser scanner data
Modeling and Simulation. Université Montpellier II - Sciences et Techniques du Languedoc, 2012. English. < NNT : 2012MON20116 >
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inria-00595483v1  Communication dans un congrès
Jérôme Guénard, Géraldine Morin, Frédéric Boudon, Pierre Gurdjos, Vincent Charvillat. Reconstruction de modèles virtuels de vignes à partir d'images
ORASIS - Congrès des jeunes chercheurs en vision par ordinateur, Jun 2011, Praz-sur-Arly, France. 2011
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hal-01084524v1  Communication dans un congrès
Pierre Fernique, Jean-Baptiste Durand, Yann Guédon. Estimation of Discrete Partially Directed Acyclic Graphical Models in Multitype Branching Processes
COMPSTAT 2014, 21st International Conference on Computational Statistics, Aug 2014, Geneva, Switzerland. 2014, Proceedings of COMPSTAT 2014, 21st International Conference on Computational Statistics. <http://compstat2014.org/>
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hal-00918597v1  Communication dans un congrès
Pierre Fernique, Jean-Baptiste Durand, Yann Guédon. Parametric Modelling of Multivariate Count Data Using Probabilistic Graphical Models
AIGM13 - 3rd Workshop on Algorithmic issues for Inference in Graphical Models, Sep 2013, Paris, France
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hal-01058317v1  Communication dans un congrès
Jean-Baptiste Durand, Yann Guédon. Quantification de l'incertitude sur la structure latente dans des modèles de Markov cachés
46èmes Journées de Statistique, Jun 2014, Rennes, France. 2014
cea-00848569v1  Article dans une revue
Mikaël Lucas, Kim Kenobi, Daniel Von Wangenheim, Ute Voß, Kamal Swarup et al.  Lateral root morphogenesis is dependent on the mechanical properties of the overlaying tissues
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America , National Academy of Sciences, 2013, 110 (13), pp.5229-34. <10.1073/pnas.1210807110>
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hal-00850814v1  Communication dans un congrès
Julien Diener, Phillipe Nacry, Christophe Périn, Anne Diévart, Xavier Draye et al.  An automated image-processing pipeline for high-throughput analysis of root architecture in OpenAlea
Risto Sievänen and Eero Nikinmaa and Christophe Godin and Anna Lintunen and Pekka Nygren. 7th International Conference on Functional-Structural Plant Models, Jun 2013, Saariselkä, Finland. pp.85-87, 2013, <http://www.metal.fi/fspm2013/proceedings>
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hal-01058313v1  Communication dans un congrès
Pierre Fernique, Jean-Baptiste Durand, Yann Guédon. Modèles graphiques paramétriques pour la modélisation des lois de génération dans des processus de branchement multitypes
46èmes Journées de Statistique, Jun 2014, Rennes, France. 2014
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hal-01088798v1  Communication dans un congrès
Alexis Joly, Julien Champ, Olivier Buisson. Instance-based bird species identication with undiscriminant features pruning - LifeCLEF 2014
CLEF: Conference and Labs of the Evaluation Forum, Sep 2014, Sheffield, United Kingdom. 2014, Information Access Evaluation meets Multilinguality, Multimodality, and Interaction. <http://clef2014.clef-initiative.eu>
hal-01190615v1  Communication dans un congrès
Yassin Refahi, Etienne Farcot, Yann Guédon, Fabrice Besnard, Teva Vernoux et al.  A combinatorial model of phyllotaxis perturbations in [i]Arabidopsis thaliana[/i]
22. Annual Symposium on Combinatorial Pattern Matching (CPM 2011), Jun 2011, Palerme, Italy. Springer-Verlag, 6661, 480 p., 2011, Lecture Notes in Computer Science
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hal-01176903v1  Communication dans un congrès
Aravind Venkatesan, Nordine El Hassouni, Florian Phillipe, Cyril Pommier, Hadi Quesneville et al.  Towards efficient data integration and knowledge management in the Agronomic domain
APIA: Applications Pratiques de l'Intelligence Artificielle , Jul 2015, Rennes, France. 1ère conférence sur les Application Pratiques de l'Intelligence Artificielle (APIA), 2015, <http://pfia2015.inria.fr/actes/index.php?procpage=apia>
hal-00919372v1  Communication dans un congrès
Jean-Baptiste Durand, Pierre Fernique. Approche graphique pour la modélisation statistique de la dépendance entre activités journalières
Workshop "Statistique, Transport et Activités", Nov 2013, Grenoble, France

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