Lire les lectures : analyse de données de séquençage

Pierre Peterlongo 1
1 GenScale - Scalable, Optimized and Parallel Algorithms for Genomics
Inria Rennes – Bretagne Atlantique , IRISA-D7 - GESTION DES DONNÉES ET DE LA CONNAISSANCE
Résumé : Tous les travaux présentés dans cette HDR concernent l’exploitation de données de séquençage haut débit en absence de génome de référence proche et de bonne qualité. Dans un premier chapitre, nous proposons de nouvelles approches pour extraire des variants biologiques d’intérêt de ces données de séquençage. Dans un second chapitre nous exposons des méthodes de comparaisons de jeux de données de séquençage. Enfin, dans un troisième chapitre, nous proposons une méthode préliminaire à de meilleurs « assemblages » de ces données de séquençage.
Document type :
Habilitation à diriger des recherches
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https://hal.inria.fr/tel-01278275
Contributor : Pierre Peterlongo <>
Submitted on : Wednesday, February 24, 2016 - 9:21:38 AM
Last modification on : Tuesday, January 29, 2019 - 10:02:08 PM
Long-term archiving on : Sunday, November 13, 2016 - 2:24:44 AM

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  • HAL Id : tel-01278275, version 1

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Pierre Peterlongo. Lire les lectures : analyse de données de séquençage. Bio-informatique [q-bio.QM]. Université rennes1, 2016. ⟨tel-01278275⟩

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