Lire les lectures : analyse de données de séquençage

Pierre Peterlongo 1
1 GenScale - Scalable, Optimized and Parallel Algorithms for Genomics
IRISA-D7 - GESTION DES DONNÉES ET DE LA CONNAISSANCE, Inria Rennes – Bretagne Atlantique
Résumé : Tous les travaux présentés dans cette HDR concernent l’exploitation de données de séquençage haut débit en absence de génome de référence proche et de bonne qualité. Dans un premier chapitre, nous proposons de nouvelles approches pour extraire des variants biologiques d’intérêt de ces données de séquençage. Dans un second chapitre nous exposons des méthodes de comparaisons de jeux de données de séquençage. Enfin, dans un troisième chapitre, nous proposons une méthode préliminaire à de meilleurs « assemblages » de ces données de séquençage.
Type de document :
HDR
Bio-informatique [q-bio.QM]. Université rennes1, 2016
Liste complète des métadonnées

https://hal.inria.fr/tel-01278275
Contributeur : Pierre Peterlongo <>
Soumis le : mercredi 24 février 2016 - 09:21:38
Dernière modification le : jeudi 15 novembre 2018 - 11:57:53
Document(s) archivé(s) le : dimanche 13 novembre 2016 - 02:24:44

Identifiants

  • HAL Id : tel-01278275, version 1

Citation

Pierre Peterlongo. Lire les lectures : analyse de données de séquençage. Bio-informatique [q-bio.QM]. Université rennes1, 2016. 〈tel-01278275〉

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