MINIA on a Raspberry Pi, Assembling a 100 Mbp Genome on a Credit Card Sized Computer - Inria - Institut national de recherche en sciences et technologies du numérique Accéder directement au contenu
Document Associé À Des Manifestations Scientifiques Année : 2013

MINIA on a Raspberry Pi, Assembling a 100 Mbp Genome on a Credit Card Sized Computer

Résumé

This work shows that the genome assembly program MINIA is able to assemble a 100 Mbp genome on a Raspberry Pi. The MINIA software was developed to drastically reduce the memory footprint needed for genome assembly, enabling human genome to be assembled on a desktop computer. Here we show that it is also able to successfully assemble a genome on a very low-end, low-power system with 512 MB RAM and a 32 GB flash drive.
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Origine : Fichiers produits par l'(les) auteur(s)

Dates et versions

hal-00842027 , version 1 (06-07-2013)

Identifiants

  • HAL Id : hal-00842027 , version 1

Citer

Guillaume Collet, Guillaume Rizk, Rayan Chikhi, Dominique Lavenier. MINIA on a Raspberry Pi, Assembling a 100 Mbp Genome on a Credit Card Sized Computer. JOBIM - Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques, Jul 2013, Toulouse, France. 2013. ⟨hal-00842027⟩
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