An Extended Network of Genomic Maintenance in the Archaeon Pyrococcus abyssi Highlights Unexpected Associations between Eucaryotic Homologs

Résumé : Chez les Archées, les protéines impliquées dans les voies de traitement de l'information génétique, incluant la réplication, la transcription et la traduction, partagent de nombreuses similarités avec celles des eucaryotes. La caractérisation des composants du complexe de la machinerie de réplication de type eucaryote a fourni de nombreuses connaissances intéressantes sur la réplication de l'ADN dans les deux domaines. En revanche, les processus de réparation de l'ADN des archées hypertermophiles sont moins bien compris et on connait très peu de choses sur l'imbrication entre les voies de synthèse, de réparation et de recombinaison. Le développement d'un système génétique pour les archées hypertermophiles est encore peu avancé, ce qui rend difficile l'utilisation d'approches complémentaires de génétique inverse et de biochimie pour élucider la fonction de nouveaux gènes candidats de réparation de l'ADN. Afin d'acquérir de nouvelles connaissances sur les processus de maintenance génomique dans les archées hypertermophiles, nous avons construit un réseau d'interactions protéiques centré sur les procédés de traitement de l'information chez Pyrococcus abyssi à partir d'expérimentations de purification par affinité et spectrométrie de masse. Le réseau comprend 132 interactions reliant 87 protéines. Ces interactions apportent des informations sur les connections entre la réplication de l'ADN et la recombinaison et la réparation, conduisant à la découverte de nouveaux composants chez les Archées et à leur association avec des homologues eukaryotiques. Bien que cette approche ne nous ait pas permis de clairement établir de nouvelles voies sur l'ADN, elle a fourni de nombreux indices précieux sur la fonction de nouveaux complexes moléculaires et la possibilité de mieux comprendre les processus de maintenance dans les archées hypertermophiles. Entre autres, nous avons mis en évidence de nouveaux partenaires potentiels de l'anneau de réplication et démontré que la protéine de liaison à l'ADN simple brin, la "Replication Protein A", augmente le taux de transcription, in vitro, de l'ARN polymérase. Cette carte d'interaction offre un outil précieux pour explorer de nouvelles facettes de l'intégrité génomique chez les Archées ainsi que potentiellement chez les Eukaryotes.
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Article dans une revue
PLoS ONE, Public Library of Science, 2013, 8 (11), pp.1-15. 〈10.1371/journal.pone.0079707〉
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Contributeur : Jacques Nicolas <>
Soumis le : vendredi 29 novembre 2013 - 20:31:02
Dernière modification le : jeudi 15 novembre 2018 - 11:57:51

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Pierre-François Pluchon, Thomas Fouqueau, Christophe Crezé, Sébastien Laurent, Julien Briffotaux, et al.. An Extended Network of Genomic Maintenance in the Archaeon Pyrococcus abyssi Highlights Unexpected Associations between Eucaryotic Homologs. PLoS ONE, Public Library of Science, 2013, 8 (11), pp.1-15. 〈10.1371/journal.pone.0079707〉. 〈hal-00911795〉

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