TmiRUSite and TmiROSite scripts: searching for mRNA fragments with miRNA binding sites with encoded amino acid residues

Olga Berillo 1 Mireille Regnier 2, 3 Anatoly Ivashchenko 1
2 AMIB - Algorithms and Models for Integrative Biology
CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR8623, Polytechnique - X, Inria Saclay - Ile de France, UP11 - Université Paris-Sud - Paris 11, LRI - Laboratoire de Recherche en Informatique, LIX - Laboratoire d'informatique de l'École polytechnique [Palaiseau]
Résumé : Nous présentons des scripts en python pour l'extraction de séquences de nucléotides de sites de fixation de miRNAs. Les données prédites sont utiles en phylogénie, pour les animaux et les plantes.
keyword : miRNA
Type de document :
Article dans une revue
Bioinformation, Biomedical Informatics Publishing Group, 2014, 10 (7), pp.472-473. 〈http://www.bioinformation.net/010/97320630010472.pdf〉
Liste complète des métadonnées

https://hal.inria.fr/hal-01071330
Contributeur : Mireille Regnier <>
Soumis le : vendredi 3 octobre 2014 - 16:49:48
Dernière modification le : jeudi 11 janvier 2018 - 06:23:08

Identifiants

  • HAL Id : hal-01071330, version 1

Citation

Olga Berillo, Mireille Regnier, Anatoly Ivashchenko. TmiRUSite and TmiROSite scripts: searching for mRNA fragments with miRNA binding sites with encoded amino acid residues. Bioinformation, Biomedical Informatics Publishing Group, 2014, 10 (7), pp.472-473. 〈http://www.bioinformation.net/010/97320630010472.pdf〉. 〈hal-01071330〉

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