TmiRUSite and TmiROSite scripts: searching for mRNA fragments with miRNA binding sites with encoded amino acid residues

Olga Berillo 1 Mireille Regnier 2, 3 Anatoly Ivashchenko 1
2 AMIB - Algorithms and Models for Integrative Biology
LIX - Laboratoire d'informatique de l'École polytechnique [Palaiseau], LRI - Laboratoire de Recherche en Informatique, UP11 - Université Paris-Sud - Paris 11, Inria Saclay - Ile de France, X - École polytechnique, CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR8623
Résumé : Nous présentons des scripts en python pour l'extraction de séquences de nucléotides de sites de fixation de miRNAs. Les données prédites sont utiles en phylogénie, pour les animaux et les plantes.
keyword : miRNA
Type de document :
Article dans une revue
Bioinformation, Biomedical Informatics Publishing Group, 2014, 10 (7), pp.472-473. 〈http://www.bioinformation.net/010/97320630010472.pdf〉
Liste complète des métadonnées

https://hal.inria.fr/hal-01071330
Contributeur : Mireille Regnier <>
Soumis le : vendredi 3 octobre 2014 - 16:49:48
Dernière modification le : jeudi 10 mai 2018 - 02:06:07

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  • HAL Id : hal-01071330, version 1

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Olga Berillo, Mireille Regnier, Anatoly Ivashchenko. TmiRUSite and TmiROSite scripts: searching for mRNA fragments with miRNA binding sites with encoded amino acid residues. Bioinformation, Biomedical Informatics Publishing Group, 2014, 10 (7), pp.472-473. 〈http://www.bioinformation.net/010/97320630010472.pdf〉. 〈hal-01071330〉

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