La bioinformatique avec Biopython

Olivier Dameron 1 Gregory Farrant 2
1 Dyliss - Dynamics, Logics and Inference for biological Systems and Sequences
Inria Rennes – Bretagne Atlantique , IRISA-D7 - GESTION DES DONNÉES ET DE LA CONNAISSANCE
Résumé : Pour faire face aux défis de la biologie, la bioinformatique propose des modules qui permettent de rendre accessibles des fonctions basiques et avancées d'analyse de données. Les données traitées sont en général des séquences d'ADN qu'il s'agira d'identifier, d'aligner et d'analyser grâce à la littérature scientifique. Les formats les plus utilisés en bioanalyse, comme les formats fasta et genbank demeurent par certains aspects difficiles à manipuler. Nous vous proposons un didacticiel qui introduira les fonctions de Biopython, un module Python dédié à la manipulation de données biologiques dans le cadre de l'analyse complète d'une séquence d'ADN.
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Article dans une revue
GNU/Linux Magazine France, Diamond Editions, 2014, pp.13
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Contributeur : Olivier Dameron <>
Soumis le : lundi 15 décembre 2014 - 16:22:47
Dernière modification le : mardi 16 janvier 2018 - 15:54:19
Document(s) archivé(s) le : lundi 16 mars 2015 - 12:20:26

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Olivier Dameron, Gregory Farrant. La bioinformatique avec Biopython. GNU/Linux Magazine France, Diamond Editions, 2014, pp.13. 〈hal-01095475〉

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