AskOmics : Intégration et interrogation de réseaux de régulation génomique et post-génomique - Archive ouverte HAL Access content directly
Conference Papers Year : 2015

AskOmics : Intégration et interrogation de réseaux de régulation génomique et post-génomique

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Abstract

Les études génomiques et post-génomiques génèrent de nombreuses données d'expression de plu-sieurs types d'ARN (messagers, micro, pi et lnc) ainsi que des informations sur la présence de marques épigé-nétiques (méthylation des histones, méthylation de l'ADN, accessibilité). L'identification des interactions entre ces différents acteurs biologiques par les biologistes à partir des fichiers tabulés contenant les données brutes est une tâche longue et difficile. AskOmics est un nouvel outil générique en cours de développement capable d'intégrer les données contenues dans des fichiers tabulés dans une base de données RDF, et de permettre aux biologistes de construire visuellement leurs requêtes sans avoir besoin de connaître la structure de la base de données ni de maitriser un langage de requêtes.
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Dates and versions

hal-01184903 , version 1 (18-08-2015)

Identifiers

  • HAL Id : hal-01184903 , version 1
  • PRODINRA : 322922

Cite

Charles Bettembourg, Olivier Dameron, Anthony Bretaudeau, Fabrice Legeai. AskOmics : Intégration et interrogation de réseaux de régulation génomique et post-génomique. IN OVIVE (INtégration de sources/masses de données hétérogènes et Ontologies, dans le domaine des sciences du VIVant et de l’Environnement), Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (INRIA). Rennes, FRA., Jun 2015, Rennes, France. pp.7. ⟨hal-01184903⟩
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