Assembler un génome sur un pico-ordinateur

Dominique Lavenier 1
1 GenScale - Scalable, Optimized and Parallel Algorithms for Genomics
IRISA-D7 - GESTION DES DONNÉES ET DE LA CONNAISSANCE, Inria Rennes – Bretagne Atlantique
Abstract : Pour assembler des génomes complexes, les traitements informatiques sont longs et exigent des ordinateurs de très grosses capacités. Grâce à une technologie logicielle à faible empreinte mémoire, l’équipe GenScale est parvenue à assembler le génome de la framboise (Raspberry en anglais) sur le Raspberry PI, un picoordinateur de la taille d’une carte de crédit. Une démonstration d’efficacité et l’assurance que la bioinformatique génomique sera bientôt adaptée aux ordinateurs standards.
Type de document :
Article dans une revue
Biofutur, Elsevier - Cachan : Lavoisier, 2015, 34 (363)
Liste complète des métadonnées

https://hal.inria.fr/hal-01235355
Contributeur : Dominique Lavenier <>
Soumis le : lundi 30 novembre 2015 - 09:54:38
Dernière modification le : mardi 16 janvier 2018 - 15:54:20

Identifiants

  • HAL Id : hal-01235355, version 1

Citation

Dominique Lavenier. Assembler un génome sur un pico-ordinateur. Biofutur, Elsevier - Cachan : Lavoisier, 2015, 34 (363). 〈hal-01235355〉

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