Quantitative analysis of metabolic networks and design of minimal bioreaction models

Résumé : Cet article tutoriel traite de la conception de modèles de bioréactions macroscopiques sur la base d’une analyse quantitative du métabolisme cellulaire sous-jacent. L’article commence par un rappel de deux techniques algébriques fondamentales pour l’analyse quantitative des réseaux métaboliques : (i) la décomposition des réseaux métaboliques complexes en chemins élémentaires (ou modes élémentaires), (ii) l’analyse des flux métaboliques qui vise à calculer la totalité des flux métaboliques intracellulaires à partir d’un ensemble limité de mesures. On montre ensuite comment ces deux techniques peuvent être exploitées pour concevoir des modèles minimaux de bioréactions en utilisant une approche systématique de réduction de modèle qui produit automatiquement une famille de modèles minimaux équivalents compatibles non seulement avec les données expérimentales mais aussi avec le métabolisme sous-jacent. La théorie est illustrée avec une étude de cas expérimentale sur des cellules CHO.
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Article dans une revue
Revue Africaine de la Recherche en Informatique et Mathématiques Appliquées, INRIA, 2008, 9
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Contributeur : Coordination Episciences Iam <>
Soumis le : mardi 23 février 2016 - 13:54:52
Dernière modification le : mardi 19 avril 2016 - 15:41:18
Document(s) archivé(s) le : mardi 24 mai 2016 - 13:21:31

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Georges Bastin. Quantitative analysis of metabolic networks and design of minimal bioreaction models. Revue Africaine de la Recherche en Informatique et Mathématiques Appliquées, INRIA, 2008, 9. 〈hal-01277922〉

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