Evaluation of long read error correction software

Résumé : Ce rapport compare plusieurs programmes de correction d'erreurs de lectures (reads) issus de la technologie de séquençage de 3ème génération (longues lectures). Les expérimentations ont été menées sur plusieurs génomes de référence. Les logiciels de correction d'erreurs évalués sont : LSC-2, Proovread, Ectools, Lordec, Nanocorr, Nas , Jabba, Pacbiotoca, Lorma et MHAP. Les 8 premiers mixent longues et courtes lectures tandis que les 3 derniers n'utilisent que des longues lectures.
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Rapport
[Research Report] RR-9028, INRIA Rennes - Bretagne Atlantique; GenScale. 2017
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Contributeur : Dominique Lavenier <>
Soumis le : jeudi 9 février 2017 - 16:59:01
Dernière modification le : mercredi 16 mai 2018 - 11:24:14

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  • HAL Id : hal-01463694, version 1

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Laurent Bouri, Dominique Lavenier. Evaluation of long read error correction software. [Research Report] RR-9028, INRIA Rennes - Bretagne Atlantique; GenScale. 2017. 〈hal-01463694〉

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