Increasing life science resources re-usability using Semantic Web technologies

Marine Louarn; Fabrice Chatonnet; Xavier Garnier; Thierry Fest; Anne Siegel; Olivier Dameron

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Increasing life science resources re-usability using Semantic Web technologies

Marine Louarn ^{1, 2} Fabrice Chatonnet ² Xavier Garnier ¹ Thierry Fest ² Anne Siegel ¹ Olivier Dameron ¹

1 Dyliss - Dynamics, Logics and Inference for biological Systems and Sequences

Inria Rennes – Bretagne Atlantique , IRISA-D7 - GESTION DES DONNÉES ET DE LA CONNAISSANCE

2 MICMAC - Microenvironment, Cell Differentiation, Immunology and Cancer

Marine Louarn ^{1, 2} AuthorId : 11562732
Author

Fabrice Chatonnet ² AuthorId : 11518272
Author IdHAL : fabrice-chatonnet ORCID : https://orcid.org/0000-0003-3639-6775

Xavier Garnier ¹ AuthorId : 313824
Author IdHAL : xavier-garnier IdRef : https://www.idref.fr/057554234

Thierry Fest ² AuthorId : 895502
Author

Anne Siegel ¹ AuthorId : 781225
Author

Olivier Dameron ¹ AuthorId : 171027
Author

1 Dyliss - Dynamics, Logics and Inference for biological Systems and Sequences (Campus de Beaulieu 35042 Rennes cedex - France) StructId : 491479

Inria Rennes – Bretagne Atlantique (Campus de beaulieu 35042 Rennes cedex - France) StructId : 419153
- Inria - Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Domaine de Voluceau Rocquencourt - BP 105 78153 Le Chesnay Cedex - France) StructId : 300009
IRISA-D7 - GESTION DES DONNÉES ET DE LA CONNAISSANCE (France) StructId : 491231
- IRISA - Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (Avenue du général Leclerc Campus de Beaulieu 35042 RENNES CEDEX - France) StructId : 490899
  - UBS - Université de Bretagne Sud (BP 92116 - 56321 Lorient cedex - France) StructId : 172265
  - INSA Rennes - Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (20, avenue des Buttes de Coësmes - CS 70839 - 35708 Rennes cedex 7 - France) StructId : 117606
    - INSA - Institut National des Sciences Appliquées (France) StructId : 301232
    - UNIV-RENNES - Université de Rennes (France) StructId : 528860
  - Inria - Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Domaine de Voluceau Rocquencourt - BP 105 78153 Le Chesnay Cedex - France) StructId : 300009
  - ENS Rennes - École normale supérieure - Rennes (Campus de Ker Lann - avenue Robert Schuman - 35170 Bruz - France) StructId : 247362
  - CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR6074 (France) StructId : 441569
  - UR1 - Université de Rennes 1 (2 rue du Thabor - CS 46510 - 35065 Rennes cedex - France) StructId : 105160
    - UNIV-RENNES - Université de Rennes (France) StructId : 528860
  - CentraleSupélec (3, rue Joliot Curie, Plateau de Moulon, 91192 GIF-SUR-YVETTE Cedex - France) StructId : 411575
  - IMT Atlantique - IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (Campus Brest : Technopôle Brest-Iroise CS 8381829238 BREST Cedex 3 - Campus Nantes : 4, rue Alfred Kastler- La chantrerie 44300 NANTES - Campus Rennes : 2 Rue de la Châtaigneraie, 35510 CESSON SEVIGNE - France) StructId : 481355
    - IMT - Institut Mines-Télécom [Paris] (37-39 Rue Dareau, 75014 Paris - France) StructId : 302102

2 MICMAC - Microenvironment, Cell Differentiation, Immunology and Cancer (INSERM UMR1236, Campus Santé, Bât 2, Université de Rennes 1, 2 Avenue du Professeur Léon Bernard, 35043 Rennes, France - France) StructId : 480724

UR1 - Université de Rennes 1 (2 rue du Thabor - CS 46510 - 35065 Rennes cedex - France) StructId : 105160
- UNIV-RENNES - Université de Rennes (France) StructId : 528860
INSERM - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale : U1236 (101, rue de Tolbiac, 75013 Paris - France) StructId : 303623
Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique - Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes (Université Rennes 1 - Campus Santé Villejean - 2, avenue Professeur Léon Bernard 35043 Rennes cedex - France) StructId : 453207

Keywords : Semantic Web bioinformatics SPARQL reproducibility of results

Document type :

Conference papers

Domain :

Computer Science [cs] / Bioinformatics [q-bio.QM]

Computer Science [cs] / Databases [cs.DB]

Computer Science [cs] / Web

Life Sciences [q-bio] / Biochemistry, Molecular Biology / Molecular Networks [q-bio.MN]

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https://hal.inria.fr/hal-02274982
Contributor : Marine Louarn Connect in order to contact the contributor
Submitted on : Friday, August 30, 2019 - 1:53:50 PM
Last modification on : Tuesday, October 19, 2021 - 11:04:40 AM

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Marine Louarn, Fabrice Chatonnet, Xavier Garnier, Thierry Fest, Anne Siegel, et al.. Increasing life science resources re-usability using Semantic Web technologies. eScience 2019 - 15th International eScience Conference, Sep 2019, San Diego, United States. pp.1-9. ⟨hal-02274982⟩

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