SVJedi : Structural variation genotyping using long reads

Lolita Lecompte; Pierre Peterlongo; Dominique Lavenier; Claire Lemaitre

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Poster communications

SVJedi : Structural variation genotyping using long reads

Lolita Lecompte ¹ Pierre Peterlongo ¹ Dominique Lavenier ¹ Claire Lemaitre ¹

1 GenScale - Scalable, Optimized and Parallel Algorithms for Genomics

Inria Rennes – Bretagne Atlantique , IRISA-D7 - GESTION DES DONNÉES ET DE LA CONNAISSANCE

Lolita Lecompte ¹ AuthorId : 1679096
Author IdHAL : lolita-lecompte ORCID : https://orcid.org/0000-0001-8773-6317

Pierre Peterlongo ¹ AuthorId : 639136
Author IdHAL : pierre-peterlongo ORCID : https://orcid.org/0000-0003-0776-6407

Dominique Lavenier ¹ AuthorId : 942485
Author IdHAL : dominique-lavenier ORCID : https://orcid.org/0000-0003-2557-680X

Claire Lemaitre ¹ AuthorId : 946111
Author Employer institution : Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique IdHAL : claire-lemaitre ORCID : https://orcid.org/0000-0001-8675-170X

1 GenScale - Scalable, Optimized and Parallel Algorithms for Genomics (Campus de Beaulieu 35042 Rennes cedex - France) StructId : 491655

Inria Rennes – Bretagne Atlantique (Campus de beaulieu 35042 Rennes cedex - France) StructId : 419153
- Inria - Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Domaine de Voluceau Rocquencourt - BP 105 78153 Le Chesnay Cedex - France) StructId : 300009
IRISA-D7 - GESTION DES DONNÉES ET DE LA CONNAISSANCE (France) StructId : 491231
- IRISA - Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (Avenue du général Leclerc Campus de Beaulieu 35042 RENNES CEDEX - France) StructId : 490899
  - UR1 - Université de Rennes 1 (2 rue du Thabor - CS 46510 - 35065 Rennes cedex - France) StructId : 105160
    - UNIV-RENNES - Université de Rennes (France) StructId : 528860
  - INSA Rennes - Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (20, avenue des Buttes de Coësmes - CS 70839 - 35708 Rennes cedex 7 - France) StructId : 117606
    - INSA - Institut National des Sciences Appliquées (France) StructId : 301232
    - UNIV-RENNES - Université de Rennes (France) StructId : 528860
  - UBS - Université de Bretagne Sud (BP 92116 - 56321 Lorient cedex - France) StructId : 172265
  - ENS Rennes - École normale supérieure - Rennes (Campus de Ker Lann - avenue Robert Schuman - 35170 Bruz - France) StructId : 247362
  - Inria - Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Domaine de Voluceau Rocquencourt - BP 105 78153 Le Chesnay Cedex - France) StructId : 300009
  - CentraleSupélec (3, rue Joliot Curie, Plateau de Moulon, 91192 GIF-SUR-YVETTE Cedex - France) StructId : 411575
  - CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR6074 (France) StructId : 441569
  - IMT Atlantique - IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (Campus Brest : Technopôle Brest-Iroise CS 8381829238 BREST Cedex 3 - Campus Nantes : 4, rue Alfred Kastler- La chantrerie 44300 NANTES - Campus Rennes : 2 Rue de la Châtaigneraie, 35510 CESSON SEVIGNE - France) StructId : 481355
    - IMT - Institut Mines-Télécom [Paris] (37-39 Rue Dareau, 75014 Paris - France) StructId : 302102

Document type :

Poster communications

Domain :

Computer Science [cs] / Bioinformatics [q-bio.QM]

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https://hal.inria.fr/hal-02290884
Contributor : Lolita Lecompte Connect in order to contact the contributor
Submitted on : Wednesday, September 18, 2019 - 9:44:02 AM
Last modification on : Monday, November 22, 2021 - 1:52:23 PM
Long-term archiving on: : Saturday, February 8, 2020 - 9:23:44 PM

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Lolita Lecompte, Pierre Peterlongo, Dominique Lavenier, Claire Lemaitre. SVJedi : Structural variation genotyping using long reads. HiTSeq 2019 - Conference on High Throughput Sequencing, Jul 2019, Basel, Switzerland. ⟨hal-02290884⟩

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