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Journal articles
PGxCorpus, a manually annotated corpus for pharmacogenomics
Joël Legrand
1
Romain Gogdemir
2
Cedric Bousquet
3
Kevin Dalleau
2
Marie-Dominique Devignes
4
William Digan
5
Chia-Ju Lee
6
Ndeye-Coumba Ndiaye
7
Nadine Petitpain
8
Patrice Ringot
9
Malika Smaïl-Tabbone
4
Yannick Toussaint
2
Adrien Coulet
2
1
SYNALP - Natural Language Processing : representations, inference and semantics
LORIA - NLPKD - Department of Natural Language Processing & Knowledge Discovery
2
ORPAILLEUR - Knowledge representation, reasonning
Inria Nancy - Grand Est, LORIA - NLPKD - Department of Natural Language Processing & Knowledge Discovery
4
CAPSID - Computational Algorithms for Protein Structures and Interactions
Inria Nancy - Grand Est, LORIA - AIS - Department of Complex Systems, Artificial Intelligence & Robotics
8
CRPV Lorraine - Centre Régional de PharmacoVigilance de Lorraine
CHRU Nancy - Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy
Joël Legrand 1
Author IdHAL : joel-legrand ORCID : https://orcid.org/0000-0002-6508-7421
Romain Gogdemir 2
Author
Cedric Bousquet 3
Author
Kevin Dalleau 2
Author IdHAL : kevin-dalleau
Marie-Dominique Devignes 4
Author IdHAL : mddevignes
William Digan 5
Author
Chia-Ju Lee 6
Author
Ndeye-Coumba Ndiaye 7
Author
Nadine Petitpain 8
Author
Patrice Ringot 9
Author
Malika Smaïl-Tabbone 4
Author IdHAL : malika-smail-tabbone
Yannick Toussaint 2
Author
Adrien Coulet 2
Author IdHAL : coulet ORCID : https://orcid.org/0000-0002-1466-062X
1
SYNALP - Natural Language Processing : representations, inference and semantics (France)
- LORIA - NLPKD - Department of Natural Language Processing & Knowledge Discovery (France)
- LORIA - Laboratoire Lorrain de Recherche en Informatique et ses Applications (Campus Scientifique BP 239 54506 Vandoeuvre-lès-Nancy Cedex - France)
- Inria - Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Domaine de Voluceau Rocquencourt - BP 105 78153 Le Chesnay Cedex - France)
- UL - Université de Lorraine (34 cours Léopold - CS 25233 - 54052 Nancy cedex - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR7503 (France)
- LORIA - Laboratoire Lorrain de Recherche en Informatique et ses Applications (Campus Scientifique BP 239 54506 Vandoeuvre-lès-Nancy Cedex - France)
2
ORPAILLEUR - Knowledge representation, reasonning (France)
- Inria Nancy - Grand Est (615 rue du Jardin Botanique 54600 Villers-lès-Nancy - France)
- Inria - Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Domaine de Voluceau Rocquencourt - BP 105 78153 Le Chesnay Cedex - France)
- LORIA - NLPKD - Department of Natural Language Processing & Knowledge Discovery (France)
- LORIA - Laboratoire Lorrain de Recherche en Informatique et ses Applications (Campus Scientifique BP 239 54506 Vandoeuvre-lès-Nancy Cedex - France)
- Inria - Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Domaine de Voluceau Rocquencourt - BP 105 78153 Le Chesnay Cedex - France)
- UL - Université de Lorraine (34 cours Léopold - CS 25233 - 54052 Nancy cedex - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR7503 (France)
- LORIA - Laboratoire Lorrain de Recherche en Informatique et ses Applications (Campus Scientifique BP 239 54506 Vandoeuvre-lès-Nancy Cedex - France)
3
LIMICS - Laboratoire d'Informatique Médicale et Ingénierie des Connaissances en e-Santé (Campus des Cordeliers/Escalier D - 15 rue de l'Ecole de Médecine 75006 Paris - France)
- INSERM - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale : U1142 (101, rue de Tolbiac, 75013 Paris - France)
- SU - Sorbonne Université (21 rue de l’École de médecine - 75006 Paris - France)
- Université Sorbonne Paris Nord (99, avenue Jean-Baptiste Clément, 93430 Villetaneuse - France)
4
CAPSID - Computational Algorithms for Protein Structures and Interactions (France)
- Inria Nancy - Grand Est (615 rue du Jardin Botanique 54600 Villers-lès-Nancy - France)
- Inria - Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Domaine de Voluceau Rocquencourt - BP 105 78153 Le Chesnay Cedex - France)
- LORIA - AIS - Department of Complex Systems, Artificial Intelligence & Robotics (France)
- LORIA - Laboratoire Lorrain de Recherche en Informatique et ses Applications (Campus Scientifique BP 239 54506 Vandoeuvre-lès-Nancy Cedex - France)
- Inria - Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Domaine de Voluceau Rocquencourt - BP 105 78153 Le Chesnay Cedex - France)
- UL - Université de Lorraine (34 cours Léopold - CS 25233 - 54052 Nancy cedex - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR7503 (France)
- LORIA - Laboratoire Lorrain de Recherche en Informatique et ses Applications (Campus Scientifique BP 239 54506 Vandoeuvre-lès-Nancy Cedex - France)
5
HEGP - Hôpital Européen Georges Pompidou [APHP] (20, rue Leblanc, 75015 Paris - France)
6
Department of Biomedical Informatics and Medical Education, University of Washington (Seattle, Washington, USA - United States)
- University of Washington [Seattle] (Seattle, Washington 98105 - United States)
7
NGERE - Nutrition-Génétique et Exposition aux Risques Environnementaux (Université de Lorraine, Faculté de Médecine, 9 avenue de la Forêt de Haye, 54500 Vandoeuvre-les-Nancy - France)
- INSERM - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale : UMRS954/UMRS1256 (101, rue de Tolbiac, 75013 Paris - France)
- UL - Université de Lorraine (34 cours Léopold - CS 25233 - 54052 Nancy cedex - France)
8
CRPV Lorraine - Centre Régional de PharmacoVigilance de Lorraine (France)
- CHRU Nancy - Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (Siège social : 29 avenue du Maréchal de Lattre de Tassigny, CO 60034, 54035 NANCY CEDEX Hôpital Central : 29 Avenue du Maréchal de Lattre de Tassigny, 54035 Nancy Hôpitaux de Brabois / Enfants : Rue du Morvan, 54500 Vandœuvre-lès-Nancy Maternité régionale :10 Avenue Dr Heydenreich, 54000 Nancy - France)
9
LORIA - Laboratoire Lorrain de Recherche en Informatique et ses Applications (Campus Scientifique BP 239 54506 Vandoeuvre-lès-Nancy Cedex - France)
- Inria - Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Domaine de Voluceau Rocquencourt - BP 105 78153 Le Chesnay Cedex - France)
- UL - Université de Lorraine (34 cours Léopold - CS 25233 - 54052 Nancy cedex - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR7503 (France)
Document type :
Journal articles
Domain :
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https://hal.inria.fr/hal-02547607
Contributor : Adrien Coulet <>
Submitted on : Monday, April 20, 2020 - 10:26:16 AM
Last modification on : Thursday, July 15, 2021 - 11:23:22 AM
Contributor : Adrien Coulet <>
Submitted on : Monday, April 20, 2020 - 10:26:16 AM
Last modification on : Thursday, July 15, 2021 - 11:23:22 AM
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Identifiers
- HAL Id : hal-02547607, version 1
- DOI : 10.1038/s41597-019-0342-9
- PUBMED : 31896797
Collections
UNIV-LORRAINE | INRIA | LORIA | LORIA-NLPKD | LORIA-AIS | LIMICS | NGERE-UL | SORBONNE-UNIVERSITE | CNRS | SORBONNE-PARIS-NORD | UNIV-PARIS13 | INSERM | SU-SCIENCES | USPC | BMS-UL | SU-TI | GRID5000 | SILECS | HUB-IA
Citation
Joël Legrand, Romain Gogdemir, Cedric Bousquet, Kevin Dalleau, Marie-Dominique Devignes, et al.. PGxCorpus, a manually annotated corpus for pharmacogenomics. Scientific Data , Nature Publishing Group, 2020, 7 (3), ⟨10.1038/s41597-019-0342-9⟩. ⟨hal-02547607⟩
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