Small Animal Shanoir (SAS) A Cloud-Based Solution for Managing Preclinical MR Brain Imaging Studies

Michael Kain; Marjolaine Bodin; Simon Loury; Yao Chi; Julien Louis; Mathieu Simon; Julien Lamy; Christian Barillot; Michel Dojat

doi:10.3389/fninf.2020.00020

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Small Animal Shanoir (SAS) A Cloud-Based Solution for Managing Preclinical MR Brain Imaging Studies

Michael Kain ^{1, *} Marjolaine Bodin ² Simon Loury ² Yao Chi ¹ Julien Louis ¹ Mathieu Simon ¹ Julien Lamy ³ Christian Barillot ¹ Michel Dojat ^{2, *}

* Corresponding author

1 Empenn

INSERM - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale, Inria Rennes – Bretagne Atlantique , IRISA-D5 - SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE

2 GIN - [GIN] Grenoble Institut des Neurosciences

3 ICube - Laboratoire des sciences de l'ingénieur, de l'informatique et de l'imagerie

Michael Kain ¹
Correspondent author

Marjolaine Bodin ²
Author

Simon Loury ²
Author

Yao Chi ¹
Author

Julien Louis ¹
Author
PersonId : 1028528

Mathieu Simon ¹
Author

Julien Lamy ³
Author
PersonId : 752305
IdHAL : lamyORCID : 0000-0002-8400-1400IdRef : 101515685

Christian Barillot ¹
Author
PersonId : 1245
IdHAL : cbarillotORCID : 0000-0002-1589-7696IdRef : 074123637

Michel Dojat ²
Correspondent author
PersonId : 1720
IdHAL : michel-dojatORCID : 0000-0003-2747-6845IdRef : 075440202

1 Empenn (Irisa, Campus de Beaulieu 35042 Rennes cedex - France) StructId : 553761

INSERM - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (101, rue de Tolbiac, 75013 Paris - France) StructId : 303623
Inria Rennes – Bretagne Atlantique (Campus de beaulieu 35042 Rennes cedex - France) StructId : 419153
- Inria - Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Domaine de Voluceau Rocquencourt - BP 105 78153 Le Chesnay Cedex - France) StructId : 300009
IRISA-D5 - SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE (France) StructId : 491232
- IRISA - Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (Avenue du général Leclerc Campus de Beaulieu 35042 RENNES CEDEX - France) StructId : 490899
  - UR1 - Université de Rennes 1 (2 rue du Thabor - CS 46510 - 35065 Rennes cedex - France) StructId : 105160
    - UNIV-RENNES - Université de Rennes (France) StructId : 528860
  - INSA Rennes - Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (20, avenue des Buttes de Coësmes - CS 70839 - 35708 Rennes cedex 7 - France) StructId : 117606
    - INSA - Institut National des Sciences Appliquées (France) StructId : 301232
    - UNIV-RENNES - Université de Rennes (France) StructId : 528860
  - UBS - Université de Bretagne Sud (BP 92116 - 56321 Lorient cedex - France) StructId : 172265
  - ENS Rennes - École normale supérieure - Rennes (Campus de Ker Lann - avenue Robert Schuman - 35170 Bruz - France) StructId : 247362
  - Inria - Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Domaine de Voluceau Rocquencourt - BP 105 78153 Le Chesnay Cedex - France) StructId : 300009
  - CentraleSupélec (3, rue Joliot Curie, Plateau de Moulon, 91192 GIF-SUR-YVETTE Cedex - France) StructId : 411575
  - CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR6074 (France) StructId : 441569
  - IMT Atlantique - IMT Atlantique (Campus Brest : Technopôle Brest-Iroise CS 8381829238 BREST Cedex 3 - Campus Nantes : 4, rue Alfred Kastler- La chantrerie 44300 NANTES - Campus Rennes : 2 Rue de la Châtaigneraie, 35510 CESSON SEVIGNE - France) StructId : 481355
    - IMT - Institut Mines-Télécom [Paris] (37-39 Rue Dareau, 75014 Paris - France) StructId : 302102

2 GIN - [GIN] Grenoble Institut des Neurosciences (Site Santé - Bâtiment Edmond J. Safra - Chemin Fortuné Ferrini 38706 La Tronche Cedex - France) StructId : 408885

INSERM - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale : U1216 (101, rue de Tolbiac, 75013 Paris - France) StructId : 303623
UGA - Université Grenoble Alpes (Adresse CS 40700 - 38058 Grenoble cedex - France) StructId : 1042703

3 ICube - Laboratoire des sciences de l'ingénieur, de l'informatique et de l'imagerie (300 bd Sébastien Brant - BP 10413 - F-67412 Illkirch Cedex - France) StructId : 217648

ENGEES - École Nationale du Génie de l'Eau et de l'Environnement de Strasbourg (1 quai Koch - BP 61039 - 67070 Strasbourg Cedex - France) StructId : 94023
UNISTRA - Université de Strasbourg (4 rue Blaise Pascal - CS 90032 - 67081 Strasbourg cedex - France) StructId : 199013
INSA Strasbourg - Institut National des Sciences Appliquées - Strasbourg (France) StructId : 261615
- INSA - Institut National des Sciences Appliquées (France) StructId : 301232
CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR7357 (France) StructId : 441569
FMNGE - Matériaux et nanosciences d'Alsace (France) StructId : 529627
- UNISTRA - Université de Strasbourg : FR3627 (4 rue Blaise Pascal - CS 90032 - 67081 Strasbourg cedex - France) StructId : 199013
- Université de Haute-Alsace (UHA) - Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (2, rue des Frères Lumière F-68093 Mulhouse Cedex - France) StructId : 237692
- INSERM - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (101, rue de Tolbiac, 75013 Paris - France) StructId : 303623
- INC - Institut de Chimie du CNRS (3 Rue Michel-Ange 75 016 Paris - France) StructId : 341038
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : FR3627 (France) StructId : 441569
Réseau nanophotonique et optique (France) StructId : 529628
- UNISTRA - Université de Strasbourg : FR3678 (4 rue Blaise Pascal - CS 90032 - 67081 Strasbourg cedex - France) StructId : 199013
- Université de Haute-Alsace (UHA) - Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (2, rue des Frères Lumière F-68093 Mulhouse Cedex - France) StructId : 237692
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique (France) StructId : 441569

Keywords : MRI data sharing image processing open science population imaging

Document type :

Journal articles

Domain :

Computer Science [cs] / Databases [cs.DB]

Computer Science [cs] / Medical Imaging

Computer Science [cs] / Web

Computer Science [cs] / Image Processing [eess.IV]

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Contributor : Laurent Jonchère Connect in order to contact the contributor
Submitted on : Tuesday, September 29, 2020 - 12:35:59 PM
Last modification on : Friday, August 5, 2022 - 2:54:52 PM
Long-term archiving on: : Wednesday, December 30, 2020 - 6:37:47 PM

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HAL Id : hal-02888669, version 1
DOI : 10.3389/fninf.2020.00020
PUBMED : 32508612

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Michael Kain, Marjolaine Bodin, Simon Loury, Yao Chi, Julien Louis, et al.. Small Animal Shanoir (SAS) A Cloud-Based Solution for Managing Preclinical MR Brain Imaging Studies. Frontiers in Neuroinformatics, Frontiers, 2020, 14, pp.1-11. ⟨10.3389/fninf.2020.00020⟩. ⟨hal-02888669⟩

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