Exploration rapide et exhaustive des banques d'ADN

Pascale Guerdoux-Jamet 1 Dominique Lavenier 1
1 API - Parallel VLSI Architectures
IRISA - Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires, INRIA Rennes
Résumé : Ce rapport présente un filtre matériel qui, intégré dans des logiciels couramment utilisés pour l'exploration des banques de séquences d'acides nucléiques, minimise deux inconvénient majeurs : la non exhaustivité des solutions et la lenteur des calculs. La substitution des parties logiciels critiques par ce dispositif matériel réduit les temps de calculs dans de très fortes proportions (de quelques heures à quelques minutes) tout en garantissant des résultats rigoureusement exactes. La mise en oeuvre étudiée (et testée sur des composants reprogrammables électriquement) propose, dans un faible volume, un accélérateur matériel qui peut aisément s'insérer dans un slot d'extension d'un PC ou d'une station de travail.
Type de document :
Rapport
[Rapport de recherche] RR-2580, INRIA. 1995
Liste complète des métadonnées

https://hal.inria.fr/inria-00074104
Contributeur : Rapport de Recherche Inria <>
Soumis le : mercredi 24 mai 2006 - 14:32:03
Dernière modification le : jeudi 11 janvier 2018 - 06:20:08
Document(s) archivé(s) le : lundi 5 avril 2010 - 00:05:07

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Identifiants

  • HAL Id : inria-00074104, version 1

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Pascale Guerdoux-Jamet, Dominique Lavenier. Exploration rapide et exhaustive des banques d'ADN. [Rapport de recherche] RR-2580, INRIA. 1995. 〈inria-00074104〉

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