Modélisation de la régulation de l'épissage alternatif au site A7 de HIV-1

Myriam Vezain 1
1 MODBIO - Computational models in molecular biology
INRIA Lorraine, LORIA - Laboratoire Lorrain de Recherche en Informatique et ses Applications
Résumé : L'épissage alternatif est un processus biologique qui intervient dans la régulation post-transcriptionelle. A travers l'élimination de certains introns, l'épissage alter- natif peut générer di érents ARNm. De récentes études biologiques sur HIV-1 mon- trent le pouvoir de la protéine Tat. Le site accepteur d'épissage A7 est requis pour la production des ARNm tat. La production de l'activateur transcriptionel Tat est hautement contrôlée à cause de ses propriétés apoptotiques. Notre objectif est de modéliser cette régulation dans le but de mieux comprendre la dynamique du virus. La site d'épissage A7 contient des éléments activateurs et des éléments inhibiteurs qui peuvent être xés par des protéines de régulation. Nous formalisons la régulation par des équations di érentielles, développant ainsi un modèle qualitatif pour le site A7 d'épissage de HIV-1. Le comportement qualitatif est dépendant des valeurs des paramètres des réactions cinétiques. Les résultats expérimentaux nous permettent de valider ce modèle à l'équilibre, confortant ainsi in silico les hypothèses formulées ex- périmentalement. Cette démarche joue ainsi un rôle essentiel dans la compréhension de la régulation de l'épissage alternatif.
Type de document :
Rapport
[Stage] A03-R-394 || vezain03a, 2003
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Contributeur : Publications Loria <>
Soumis le : mardi 26 septembre 2006 - 09:40:01
Dernière modification le : jeudi 11 janvier 2018 - 06:19:52

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Myriam Vezain. Modélisation de la régulation de l'épissage alternatif au site A7 de HIV-1. [Stage] A03-R-394 || vezain03a, 2003. 〈inria-00099672〉

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