Large-scale gene discovery in the pea aphid Acyrthosiphon pisum (Hemiptera)

Beatriz Sabater-Munoz 1 Fabrice Legeai 2 Claude Rispe 1 Joël Bonhomme 1 Peter Dearden 3, 4 Carole Dossat 5 Aymeric Duclert 2 Jean-Pierre Gauthier 1 Danièle Giblot Ducray 1 Wayne Hunter 6, 7 Phat Dang 6, 7 Srini Kambhampati 8 David Martinez-Torres 9 Teresa Cortes 9 Andrès Moya 9 Atsushi Nakabachi 10 Cathy Philippe 2 Nathalie Prunier-Leterme 1 Yvan Rahbé 11 Jean-Christophe Simon 1, 12 David Stern 13 Patrick Wincker 5 Denis Tagu 1
1 BIO3P - Biologie des organismes et des populations appliquées à la protection des plantes
2 URGI - Unité de Recherche Génomique Info
3 Biochemistry Department
4 University of Otago [Dunedin, Nouvelle-Zélande]
5 UMR 8030 - Génomique métabolique
6 Horticultural Research Laboratory
7 U.S. Horticultural Research Laboratory ( Fort Pierce, USA)
8 Department of Entomology
9 ICBiBE - Institut Cavanilles de Biodiversitat i Biologia Evolutiva
10 RIKEN - Environmental Molecular Biology Laboratory
11 BF2I - Biologie Fonctionnelle, Insectes et Interactions
12 AGROCAMPUS OUEST [Le Rheu]
13 Department of Ecology and Evolutionary Biology [Princeton]
Abstract : Aphids are the leading pests in agricultural crops. A large-scale sequencing of 40,904 ESTs from the pea aphid Acyrthosiphon pisum was carried out to define a catalog of 12,082 unique transcripts. A strong AT bias was found, indicating a compositional shift between Drosophila melanogaster and A. pisum. An in silico profiling analysis characterized 135 transcripts specific to pea-aphid tissues (relating to bacteriocytes and parthenogenetic embryos). This project is the first to address the genetics of the Hemiptera and of a hemimetabolous insect.
Keywords : Codon Position Aphid Species Additional Data File Gene Ontology cDNA Library
Type de document :
Article dans une revue
Genome Biology, BioMed Central, 2006, 7-3 (r21), pp.1-11. 〈10.1186/gb-2006-7-3-r21〉
Liste complète des métadonnées
https://hal.inria.fr/inria-00180157
Contributeur : Fabrice Legeai <>
Soumis le : mercredi 16 janvier 2019 - 11:28:40
Dernière modification le : jeudi 7 février 2019 - 15:31:18

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gb-2006-7-3-r21.pdf
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Beatriz Sabater-Munoz, Fabrice Legeai, Claude Rispe, Joël Bonhomme, Peter Dearden, et al.. Large-scale gene discovery in the pea aphid Acyrthosiphon pisum (Hemiptera). Genome Biology, BioMed Central, 2006, 7-3 (r21), pp.1-11. 〈10.1186/gb-2006-7-3-r21〉. 〈inria-00180157〉

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