Probabilistic Interpretation for the Nonlinear Poisson-Boltzmann Equation in Molecular Dynamics

Nicolas Perrin 1
1 TOSCA - TO Simulate and CAlibrate stochastic models
CRISAM - Inria Sophia Antipolis - Méditerranée , IECL - Institut Élie Cartan de Lorraine : UMR7502
Résumé : En dynamique moléculaire, l'équation de Poisson-Boltzmann (PB) permet de décrire le potentiel électrostatique d'un système moléculaire composé d'une molécule dans un solvant. Ce potentiel électrostatique intervient dans les modèles de simulation numérique permettant de comprendre la structure, la dynamique et le fonctionnement des protéines. La résolution numérique de l'équation de PB est donc une étape importante de ces simulations. Aussi, nous proposons une interprétation probabiliste de l'équation de PB non-linéaire à l'aide des Equations Différentielles Stochastiques Rétrogrades (EDSR). Cette interprétation nécessite une adaptation des résultats d'existence et d'unicité des solutions d'EDSR.
Type de document :
Pré-publication, Document de travail
2012
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Contributeur : Nicolas Perrin <>
Soumis le : jeudi 1 mars 2012 - 14:49:03
Dernière modification le : samedi 27 janvier 2018 - 01:30:49
Document(s) archivé(s) le : mercredi 14 décembre 2016 - 09:28:41

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Nicolas Perrin. Probabilistic Interpretation for the Nonlinear Poisson-Boltzmann Equation in Molecular Dynamics. 2012. 〈hal-00648180v3〉

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